Esistono molti metodi che possono essere utilizzati per separare le miscele, a seconda delle proprietà fisiche delle sostanze coinvolte. Ad esempio, se le sostanze hanno punti di ebollizione diversi, possono essere separate mediante distillazione. Se hanno densità diverse possono essere separati mediante centrifugazione o filtrazione. Se hanno proprietà magnetiche diverse, possono essere separati mediante separazione magnetica.
Al contrario, i composti non possono essere separati nei loro elementi costitutivi mediante metodi fisici. Questo perché gli elementi di un composto sono legati chimicamente tra loro e i legami possono essere rotti solo mediante reazioni chimiche.
Pertanto, generalmente è molto più semplice separare le miscele che i composti.