* Isotopi: L'idrogeno ha tre isotopi:Prouti (¹H), deuterio (²H) e trizio (³H). Mentre il protium è il più comune, tutti e tre gli isotopi possono essere trovati in acqua. Il deuterio ha un neutrone extra, che lo rende più pesante di Protium e il trizio ha due neutroni extra. Queste differenze di massa possono influenzare le proprietà fisiche della molecola d'acqua.
* Ambiente chimico: Anche gli atomi di protium nelle molecole d'acqua possono essere leggermente diversi dagli altri atomi di protium. Questo perché l'ambiente chimico che circonda un atomo può influenzare le sue proprietà. Ad esempio, gli atomi di idrogeno nelle molecole d'acqua sono legati all'ossigeno, il che può alterare leggermente la distribuzione e la reattività degli elettroni.
Pertanto, mentre tutti gli atomi di idrogeno condividono la stessa struttura di base (un protone e un elettrone), possono variare nella loro composizione isotopica e nel loro ambiente chimico specifico, rendendoli non completamente identici.