* d-galattosio (uno zucchero a sei carbonio)
* 3,6-anidro-L-galattosio (uno zucchero a sei carbonio modificato)
Queste unità di agarobiose sono collegate insieme da alternati α- (1 → 3) e β- (1 → 4) legami glicosidici .
Oltre alla principale struttura di agarobiosio, l'agarosio può contenere anche piccole quantità di altri zuccheri come solfato , acidi uronici e acido piruvico così come proteine e sali .
La presenza di questi componenti aggiuntivi può variare a seconda della fonte delle alghe da cui viene estratta l'agarosio, risultando in lievi variazioni nelle proprietà fisiche dell'agarosio.