I ricercatori dell'Istituto di ingegneria molecolare e dell'Argonne National Laboratory hanno sviluppato una piattaforma per fornire dati ricercabili delle pubblicazioni degli scienziati al fine di affrontare il problema della riproducibilità. Credito:shutterstock.com
La comunità scientifica ha lottato con il problema della riproducibilità dei dati, un passaggio chiave nel processo che guida il modo in cui la maggior parte degli scienziati crea conoscenza nel proprio campo.
Secondo un recente sondaggio, più del 70 percento dei ricercatori ha provato e non è riuscito a riprodurre gli esperimenti pubblicati da un altro scienziato. Più della metà non è nemmeno riuscita a riprodurre con successo le proprie indagini. Ciò pone la domanda:se un esperimento o una simulazione non possono essere riprodotti, ha avuto successo in primo luogo?
I ricercatori dell'Istituto di ingegneria molecolare dell'Università di Chicago e dell'Argonne National Laboratory mirano a risolvere questo problema con una nuova piattaforma software che consente agli scienziati di condividere i dati di ciascuna delle loro pubblicazioni in modo ricercabile. Negli ultimi due anni hanno sviluppato uno strumento per curare, scoprire ed esplorare articoli scientifici riproducibili chiamati Qresp, che è ora disponibile per l'uso pubblico.
"Il nostro obiettivo è accelerare il processo scientifico e ridurre il tempo necessario per condividere le conoscenze tra i ricercatori, " disse Giulia Galli, il Liew Family Professor di Ingegneria Molecolare. "Rendendo i dati disponibili e ricercabili, speriamo di rendere più facile per i ricercatori riprodurre i risultati".
Il processo di riproduzione dei risultati scientifici rimane una questione complessa. Articoli pubblicati, che sono disponibili online come PDF, spesso non includono informazioni sufficienti sui dati e sui processi risultanti per consentire ad altri di riprodurre i risultati, e i dati spesso non sono messi a disposizione della comunità scientifica.
"Molti documenti non includono dettagli sufficienti per poter riprodurre i dati, " disse Marco Govoni, assistente scienziato all'Argonne e visiting scientist all'Università di Chicago. "E spesso la maggior parte dei dati ottenuti e utilizzati nel documento non sono affatto disponibili. Per ottenere quei dati, a volte è necessario scrivere agli autori dell'articolo. Non dovrebbe essere così difficile, e non dovrebbe essere un processo ad hoc".
Con Qresp, i ricercatori sperano di contribuire ad alleviare alcune delle attuali difficoltà nel rendere i dati aperti e riproducibili. Il software guida gli utenti attraverso il processo di organizzazione e condivisione dei propri dati, inclusi set di dati e grafici. Tutti i campi sono personalizzabili, lasciando che i ricercatori curino i loro dati nel modo migliore in base al documento che hanno scritto. La piattaforma è disponibile anche per chiunque voglia esplorare i dati condivisi da altri ricercatori.
Sebbene ci siano stati diversi sforzi per gestire grandi insiemi di dati, la maggior parte di questi sforzi si basa su un repository centrale, mentre Qresp si basa su un modello distribuito. All'interno della piattaforma, i ricercatori non caricano dati ma piuttosto ospitano i propri dati curati e decidono cosa vogliono condividere. Quel modo, Qresp fornisce una soluzione scalabile per la condivisione dei dati, ha detto Govoni.
I ricercatori che potrebbero non voler fare questo passo in più per condividere i propri dati subito dopo la pubblicazione dovrebbero considerare i vantaggi dell'organizzazione e della condivisione dei dati per il proprio gruppo, disse Galli. Gli studenti del suo gruppo ora curano automaticamente i loro dati in Qresp come un ulteriore passo nella loro ricerca scientifica. Qresp facilita il trasferimento di informazioni e conoscenze tra progetti realizzati da studenti diversi, e tra i ricercatori che restano e quelli che lasciano il gruppo.
"L'intero processo di condivisione dei dati nel gruppo è diventato molto più efficiente, " disse Galli, che è anche professore di chimica e scienziato senior all'Argonne.
Con l'uso e l'adozione di Qresp da parte di un'ampia comunità di ricercatori, gli articoli pubblicati possono diventare molto più interattivi, un'interfaccia vivente in cui, cliccando su un'immagine, un ricercatore può vedere il set di dati dietro i risultati.
"Vogliamo alzare l'asticella della riproduzione dei risultati scientifici, e vogliamo andare oltre la pubblicazione di PDF e condividere ricerche molto più interattive e utili, " ha detto Govoni.