1. Inerzia evolutiva:l'evoluzione è un processo lento e alcuni tratti possono persistere in una specie anche dopo aver perso la loro funzione originale. Nel caso delle rane diurne, potrebbero aver ereditato i geni per la visione notturna dai loro antenati notturni e questi geni non sono stati eliminati attraverso la selezione naturale perché non hanno conseguenze negative sulla sopravvivenza delle rane.
2. Pleiotropia:molti geni hanno molteplici funzioni e i geni associati alla visione notturna possono avere anche altri ruoli importanti nella fisiologia o nel comportamento delle rane. Ad esempio, alcuni di questi geni potrebbero essere coinvolti nella produzione di proteine essenziali per la salute generale delle rane, e potrebbero essere stati conservati anche se non sono più necessari per la visione notturna.
3. Cambiamenti nelle condizioni ambientali:sebbene le rane diurne siano attualmente attive durante il giorno, è possibile che i loro antenati fossero notturni. Se le condizioni ambientali cambiavano nel tempo, come la disponibilità di cibo o la presenza di predatori, le rane potrebbero aver spostato la loro attività durante il giorno, ma avrebbero conservato i geni per la visione notturna come riserva nel caso in cui le condizioni cambiassero nuovamente.
4. Vincoli di sviluppo:lo sviluppo di un organismo è un processo complesso e potrebbero esserci vincoli che impediscono la completa perdita di determinati geni o tratti. Ad esempio, i geni per la visione notturna potrebbero essere collegati ad altri geni essenziali per lo sviluppo degli occhi delle rane, e l'eliminazione dei geni per la visione notturna potrebbe anche interrompere lo sviluppo di altre strutture importanti.
Nel complesso, la ritenzione dei geni associati alla visione notturna nelle specie di rane diurne è probabilmente dovuta a una combinazione di questi fattori e ciò evidenzia la natura complessa dei processi evolutivi.