I legami idrogeno si formano quando un atomo di idrogeno è legato a un atomo altamente elettronegativo, come fluoro, ossigeno o azoto. L'atomo elettronegativo allontana gli elettroni dall'atomo di idrogeno, creando una carica parziale positiva sull'atomo di idrogeno. Questa carica parziale positiva può quindi interagire con una carica parziale negativa su un altro atomo elettronegativo, creando un legame idrogeno.
I legami idrogeno sono responsabili dell’alto punto di ebollizione dell’acqua e di altre molecole polari. Svolgono anche un ruolo importante nella struttura e nella funzione delle proteine e del DNA.