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  • La ricerca mostra come le molecole di DNA attraversano i nanopori
    Le molecole di DNA si muovono attraverso i nanopori sotto una tensione applicata, un fenomeno fondamentale per il sequenziamento del DNA e altre applicazioni nella nanobiotecnologia. Nonostante molti studi sperimentali e computazionali, il meccanismo dettagliato della traslocazione del DNA rimane poco chiaro. Qui abbiamo impiegato simulazioni di dinamica molecolare atomistica a lungo termine insieme ad esperimenti di traslocazione per chiarire la dinamica di decompressione. Le simulazioni rivelano che la traslocazione di una singola molecola di DNA è mediata da una dinamica collettiva di più coppie di basi che interagiscono in modo cooperativo con la superficie del nanoporo. La dinamica di decompressione mostra raffiche intermittenti, che portano alla traslocazione delle basi del DNA con un passo di 0,34 nm, che è la metà del passo del DNA a doppio filamento. Questa scoperta risolve il dibattito di lunga data sulla questione se la dimensione del passo di traslocazione del DNA sia 0,34 nm o 0,68 nm. I nostri risultati svelano i dettagli atomistici del meccanismo di traslocazione e forniscono informazioni sulla progettazione di dispositivi basati su nanopori per l’analisi e la manipolazione del DNA.
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