Si pensa che H. floresiensis si sia evoluto da un ominide primitivo arrivato a Flores circa 840.000 anni fa. Si ritiene che questi primi ominidi si siano arenati sull'isola e, nel tempo, si siano evoluti in una forma più piccola e compatta. Si ritiene che questa riduzione delle dimensioni sia il risultato del nanismo delle isole, un fenomeno che si verifica quando gli animali che vivono sulle isole diventano più piccoli dei loro parenti continentali.
Si ritiene che il nanismo delle isole si verifichi per una serie di ragioni, tra cui risorse limitate, concorrenza di altre specie e mancanza di predatori. Nel caso dell'Homo floresiensis, si pensa che le risorse limitate dell'isola e la concorrenza di altri animali, come i ratti giganti e i draghi di Komodo, possano essere stati i fattori principali che hanno portato alle sue piccole dimensioni.
H. floresiensis è una delle specie di ominidi più interessanti ed enigmatiche mai scoperte. Le sue piccole dimensioni, le sue caratteristiche uniche e il fatto che sia vissuto fino a tempi relativamente recenti lo rendono una parte importante della storia dell'evoluzione umana.
