1. Geni dell'orologio:al centro dell'orologio circadiano c'è un gruppo di geni dell'orologio, spesso definiti "geni dell'orologio centrale". Nei mammiferi, i geni orologio più studiati sono Clock (Circadian Locomotor Output Cycles Kaput) e Bmal1 (Brain and Muscle Arnt-Like 1). Questi geni codificano per proteine che formano un complesso eterodimerico chiamato complesso CLOCK-BMAL1.
2. Ciclo di feedback trascrizione-traduzione:il complesso CLOCK-BMAL1 agisce come un fattore di trascrizione che regola l'espressione di altri geni orologio. Si lega a specifiche sequenze di DNA chiamate E-box all'interno dei promotori di questi geni orologio, promuovendone la trascrizione. Tra i geni attivati da CLOCK-BMAL1 ci sono i geni Period (Per) e Criptocromo (Cry).
3. Ciclo di feedback negativo:man mano che le proteine PER e CRY si accumulano, si accumulano gradualmente nel citoplasma e alla fine si traslocano nuovamente nel nucleo. Nel nucleo formano complessi e inibiscono l'attività del complesso CLOCK-BMAL1, riducendo così la trascrizione dei geni Per e Cry. Questo ciclo di feedback negativo si traduce in una diminuzione dei livelli di proteine PER e CRY, consentendo al ciclo di ricominciare.
4. Regolazione post-traduzionale:oltre alla regolazione trascrizionale, i ritmi circadiani sono influenzati anche da modifiche post-traduzionali delle proteine dell'orologio. Queste modifiche, come la fosforilazione e l’ubiquitinazione, influenzano la stabilità, la localizzazione e l’attività delle proteine orologio, contribuendo ulteriormente alla precisa tempistica del ciclo circadiano.
È importante notare che l'orologio circadiano non dipende esclusivamente da questi geni fondamentali dell'orologio. Anche altri fattori, come segnali ambientali (ad esempio la luce), segnali ormonali e input neuronali, possono influenzare la tempistica e la sincronizzazione dei ritmi circadiani.
La notevole precisione e adattabilità degli orologi circadiani consentono agli organismi di anticipare e rispondere ai cambiamenti quotidiani nel loro ambiente, ottimizzando i processi fisiologici e comportamentali per la sopravvivenza e il benessere generale.