Gli scienziati hanno la capacità di sequenziare la molecola del DNA; in altre parole, possono determinare l'ordine delle basi nucleotidiche in ogni data molecola. Il sequenziamento della molecola di DNA può essere il primo di una serie di passaggi necessari per capire come gli specifici nucleotidi in una molecola di DNA interagiscono tra loro e codificano per caratteristiche diverse in un organismo. Il processo di sequenziamento del DNA è piuttosto coinvolto, ma i sequenziatori automatici del DNA stanno minimizzando il coinvolgimento umano necessario, almeno per una parte del processo.
Preparazione del campione
Perché un sequenziatore automatico del DNA funzioni, deve rilevare le quattro basi nucleotidiche che costituiscono il DNA: adenina, guanina, timina e citosina. Gli scienziati copiano un pezzo di DNA molte volte e usano enzimi di restrizione per tagliare il DNA in pezzi di varie dimensioni. Quindi aggiungono una piccola quantità di base marcata fluorescente a ciascun lotto di DNA. La base, che è adenina, timina, guanina o citosina, si legherà al suo complemento di base all'estremità di una ciocca. Ad esempio, l'adenina si legherà a fili che terminano con la timina e la guanina si legherà a fili che terminano con citosina.
Sequenziamento automatico del sequenziatore del DNA
Un sequenziatore automatico del DNA è costruito come un sequenziatore del DNA che richiede più lavoro manuale. In particolare, un sequenziatore automatico del DNA è un serbatoio, lungo circa 1 piede, con 96 pozzetti di gel in cui è possibile versare il DNA. In un sequenziatore di DNA automatico, proprio come in ogni sequenziatore di DNA, il DNA viene iniettato nei pozzetti di gel nella parte superiore del serbatoio e una carica negativa viene applicata a quella parte del serbatoio. La carica negativa fornisce un forte impulso per i filamenti di DNA a percorrere diverse distanze, fino alla fine del serbatoio.
Iniezione automatica
Un sequenziatore automatico di DNA inietta lotti di DNA, automaticamente, nel parte superiore del gel. In quanto tale, risparmia ai ricercatori un'enorme quantità di tempo e sforzi. Dopo che i lotti sono stati iniettati, il sequenziatore applica automaticamente una carica negativa a un'estremità del serbatoio, facendo migrare i filamenti a distanze variabili attraverso il gel. Le diverse distanze riflettono le diverse dimensioni dei filamenti di DNA che passano attraverso il gel.
Detector
Molte macchine di sequenziamento automatico del DNA sono impostate per rilevare il colorante fluorescente sui fili del DNA che passa attraverso il gel . In tal modo, possono identificare i nucleotidi che si trovano all'estremità dei fili e registrarli nel computer. Tuttavia, i sequencer, nella migliore delle ipotesi, presentano una versione confusa dei nucleotidi del DNA. Dopo aver utilizzato una macchina automatica per il sequenziamento del DNA, è necessario passare attraverso un processo chiamato "finishing", in cui una combinazione di computer e ricercatori separa i risultati dal filamento di DNA che rileva per assemblare i dati in una descrizione completa di un filamento di DNA. Non sorprendentemente, questo processo può richiedere molto più tempo rispetto al processo effettivo di sequenziamento.
