Un team di ricercatori dell'Università della California, Berkeley, ha sviluppato un nuovo metodo per calcolare come le proteine ​​interagiscono con i farmaci. Il metodo, chiamato “calcolatore universale e accurato dell’interazione proteina-ligando” (UNAPLICA), è in grado di prevedere con precisione l’affinità di legame di un farmaco con una proteina, che è essenziale per comprendere come funzionano i farmaci e progettarne di nuovi.

Il metodo UNAPLICA si basa su un algoritmo di apprendimento automatico addestrato su un ampio set di dati di interazioni proteina-ligando. L'algoritmo è stato in grado di apprendere i principi generali che governano il modo in cui interagiscono proteine ​​e ligandi e ora può essere utilizzato per prevedere l'affinità di legame di un nuovo farmaco con una proteina senza la necessità di esperimenti costosi e dispendiosi in termini di tempo.

I ricercatori affermano che UNAPLICA rappresenta un importante passo avanti nel campo della scoperta di farmaci, poiché consentirà agli scienziati di valutare rapidamente e facilmente il potenziale di un nuovo farmaco candidato. Ciò potrebbe portare allo sviluppo di nuovi farmaci più efficaci e con minori effetti collaterali.

Come funziona UNAPLICA

Il metodo UNAPLICA funziona generando innanzitutto un modello tridimensionale del complesso proteina-ligando. Questo modello viene quindi utilizzato per calcolare l'energia di interazione tra la proteina e il ligando, che è una misura della forza con cui le due molecole si legano tra loro.

L'energia di interazione viene calcolata utilizzando una varietà di metodi, tra cui la meccanica quantistica, la meccanica molecolare e i campi di forza empirici. Il metodo UNAPLICA utilizza quindi algoritmi di apprendimento automatico per apprendere i principi generali che governano il modo in cui interagiscono proteine ​​e ligandi. Ciò consente al metodo di prevedere l'affinità di legame di un nuovo farmaco con una proteina senza la necessità di esperimenti costosi e dispendiosi in termini di tempo.

Applicazioni di UNAPLICA

Il metodo UNAPLICA ha un ampio campo di applicazioni nel campo della scoperta di farmaci. Può essere utilizzato per:

* Valuta rapidamente e facilmente il potenziale di un nuovo farmaco candidato.

* Progettare nuovi farmaci che siano più efficaci e abbiano meno effetti collaterali.

* Ottimizza il dosaggio di un farmaco.

* Comprendere come i farmaci interagiscono con altre molecole nel corpo.

Il metodo UNAPLICA è un potente strumento che potrebbe portare allo sviluppo di nuovi farmaci più efficaci e con minori effetti collaterali. Ciò potrebbe avere un impatto notevole sulla salute e sul benessere delle persone in tutto il mondo.