Le cellule staminali dell'epitelio intestinale si trovano nelle cripte di Lieberkühn, che sono piccole depressioni nel rivestimento intestinale. Queste cellule staminali si dividono simmetricamente per produrre più cellule staminali e si dividono anche asimmetricamente per produrre cellule TA (transit-amplifying). Le cellule TA poi si dividono più volte per produrre cellule epiteliali immature, che migrano nella cripta e alla fine si differenziano in cellule epiteliali mature.
Le cellule epiteliali mature rivestono la superficie dell'intestino e sono responsabili dell'assorbimento dei nutrienti, della secrezione del muco e della protezione del corpo dalle sostanze nocive. Alla fine si staccano nel lume dell'intestino e vengono sostituite da nuove cellule provenienti dalla cripta.
Il processo di proliferazione e differenziazione delle cellule epiteliali è strettamente regolato da una serie di fattori, tra cui fattori di crescita, citochine e ormoni. Questi fattori controllano il tasso di divisione delle cellule staminali, la proliferazione delle cellule TA e la differenziazione delle cellule epiteliali.
Le interruzioni del processo di rinnovamento delle cellule epiteliali possono portare a una serie di malattie intestinali, tra cui il morbo di Crohn, la colite ulcerosa e il cancro del colon-retto.