Nella trascrizione, il filamento modello di DNA funge da guida per la sintesi dell'RNA messaggero (mRNA) mediante accoppiamento di basi complementari con ribonucleotidi. Durante questo processo, specifiche basi azotate sul filamento di DNA si accoppiano con le loro basi complementari sui ribonucleotidi in arrivo. Ecco le regole di accoppiamento delle basi durante la trascrizione:

- Adenina (A) sul filamento modello del DNA si accoppia con Uracile (U) sul filamento di RNA.

- Timina (T) sul filamento modello del DNA rimane spaiato, poiché non esiste una base corrispondente nell'RNA.

- Citosina (C) sul filamento modello del DNA si accoppia con la guanina (G) sul filamento di RNA.

- Guanina (G) sul filamento modello del DNA si accoppia con la citosina (C) sul filamento di RNA.

Durante la trascrizione, un enzima RNA polimerasi legge il filamento modello di DNA nella direzione da 5' a 3' e sintetizza una molecola di RNA complementare aggiungendo sequenzialmente ribonucleotidi nella direzione da 5' a 3'. Questo meccanismo di accoppiamento delle basi garantisce che la trascrizione dell'RNA sia una copia accurata del modello di DNA, ad eccezione della presenza di uracile (U) al posto di timina (T), rendendolo adatto alla traduzione in proteine.