La fosforilazione dell'ADP coinvolge tre subunità specifiche all'interno del dominio CF1:
subunità α: Questa subunità contiene il sito attivo per la sintesi e l'idrolisi dell'ATP. Lega l'ADP e il fosfato inorganico (Pi) e facilita la reazione chimica che converte l'ADP in ATP.
subunità β: La subunità β contribuisce al legame di ADP e Pi al sito catalitico sulla subunità α. Partecipa anche ai cambiamenti conformazionali che si verificano durante la sintesi e l'idrolisi dell'ATP.
subunità γ: La subunità γ svolge un ruolo cruciale nella trasduzione dell'energia. Collega la subunità c rotante nel dominio transmembrana (CF0) alle subunità catalitiche α e β nel dominio CF1. La rotazione della subunità γ dovuta al gradiente protonico attraverso la membrana tilacoide guida i cambiamenti conformazionali che portano alla fosforilazione dell'ADP.
Queste tre subunità, insieme ad altri componenti del dominio CF1, lavorano insieme per facilitare la fosforilazione dell'ADP e la sintesi dell'ATP nell'ATP sintasi del cloroplasto.