Ecco perché:
* Mutazioni sinonimi sono cambiamenti nella sequenza del DNA che non alterano la sequenza di aminoacidi della proteina codificata dal gene. Questo perché il codice genetico è ridondante, il che significa che più codoni possono codificare per lo stesso aminoacido.
* Mutazioni non sinonimo , d'altra parte, modificare la sequenza di aminoacidi, che può potenzialmente alterare la funzione e la struttura della proteina.
* Inserimento ed eliminazioni (Indels) può causare cambiamenti di frame, portando a cambiamenti significativi nella sequenza proteica e richiedendo un vasto riallineamento.
Poiché le mutazioni sinonimi non cambiano la sequenza proteica, hanno un impatto minimo sulla struttura e sulla funzione generale del gene. Ciò li rende meno probabili per interrompere l'allineamento delle regioni omologhe tra diverse specie.
Pertanto, una mutazione sinonimo richiederebbe meno il riallineamento delle regioni omologhe in un gene comune a diverse specie correlate.
