1. Prove genomiche e molecolari:
* Struttura ribosomiale RNA (rRNA): Archaea ed eucarioti condividono una struttura di rRNA più simile rispetto ai batteri. Questa è stata una delle prime prove che suggeriscono la loro stretta relazione.
* Sintesi proteica: Sia gli archaea che gli eucarioti utilizzano un insieme simile di fattori di iniziazione e allungamento per la sintesi proteica, mentre i batteri usano un set distinto.
* Organizzazione genica: Gli archaea hanno geni organizzati in operoni come i batteri, ma gli operoni negli archea sono più simili nella struttura a quelli trovati negli eucarioti.
* istoni: Mentre i batteri mancano di istoni, l'archaea possiede proteine simili all'istone che aiutano a organizzare il loro DNA, una caratteristica simile agli eucarioti.
* Struttura della membrana cellulare: Gli archaea hanno lipidi di membrana unici che sono più simili ai lipidi eucariotici rispetto ai lipidi batterici.
2. Storia evolutiva:
* Analisi filogenetica: Gli alberi filogenetici basati su vari marcatori molecolari (rRNA, sequenze di proteine) collocano costantemente Archaea come gruppo gemello più vicino agli eucarioti. Ciò suggerisce un antenato comune per Archaea ed Eucarioti.
* Trasferimento genico orizzontale: Le prove suggeriscono che c'è stato un vasto trasferimento genico orizzontale tra archaea ed eucarioti, in particolare nelle prime fasi della loro evoluzione.
3. Caratteristiche metaboliche e cellulari:
* Percorsi metabolici: Archaea ed eucarioti condividono alcuni percorsi metabolici non trovati nei batteri, come la capacità di riparare il gas azoto.
* Divisione cellulare: Il meccanismo della divisione cellulare in Archaea è più simile agli eucarioti che ai batteri.
* Trascrizione e traduzione: Mentre i batteri utilizzano un sistema più semplice per questi processi, Archaea ed eucarioti hanno macchinari più complessi.
Tuttavia, è importante notare che:
* Archaea ed eucarioti sono domini distinti della vita: Non sono semplicemente "strettamente correlati":sono rami separati sull'albero della vita.
* La relazione evolutiva tra archaea ed eucarioti è complessa: Mentre ci sono prove forti per la loro stretta relazione, ci sono anche differenze tra loro. Alcuni ricercatori ritengono che l'ultimo antenato comune di Archaea ed Eucarioti fosse probabilmente più complesso di quanto si pensasse in precedenza.
La comprensione attuale è che Archaea ed Eucarioti condividono un antenato comune che si discostava dal lignaggio che porta a batteri. Ciò rende Archaea più strettamente correlato agli eucarioti che ai batteri. Tuttavia, la natura specifica di questa relazione e gli eventi evolutivi che portano alla diversificazione di questi settori sono ancora attivamente studiati.