Sebbene non tecnicamente inventato nel XVI secolo (i primi microscopi rudimentali sono apparsi prima), è stato durante questo periodo che il microscopio composto è stato sviluppato, consentendo un ingrandimento molto più elevato e rivelando il mondo nascosto delle strutture microscopiche. Ciò è stato cruciale nello sviluppo della teoria cellulare, in quanto ha permesso agli scienziati come Robert Hooke di osservare e descrivere la struttura cellulare delle piante e di altri materiali per la prima volta.
