* Mitocondri: Questi organelli, spesso chiamati "centrali elettriche della cellula", hanno il loro DNA, chiamato DNA mitocondriale (mtDNA). Questa molecola circolare del DNA è responsabile di alcune funzioni mitocondriali.
* Cloroplasti: Simile ai mitocondri, questi organelli trovati nelle cellule vegetali contengono anche la loro molecola circolare di DNA chiamata DNA cloroplasta (cpDNA). Ha un ruolo nella fotosintesi.
È importante notare che mtDNA e cpDNA non sono non formato nel nucleo. Hanno i loro macchinari di replica e sono ereditati indipendentemente dal DNA nucleare.
Pertanto, mentre il DNA si trova principalmente nel nucleo, ci sono altre posizioni all'interno delle cellule eucariotiche in cui si può trovare anche:mitocondri e cloroplasti.