Ecco perché:
* Funzionalità condivise: Archaea ed eucarioti condividono diverse caratteristiche uniche non trovate nei batteri, come:
* Strutture geniche simili e meccanismi di trascrizione
* Strutture di ribosoma simili
* La presenza di proteine simili all'istone che aiutano a organizzare il DNA
* L'uso di lipidi di membrana simili
* Evidenza filogenetica: Studi filogenetici molecolari, in particolare quelli che analizzano sequenze di RNA ribosomiale, supportano fortemente l'idea che Archaea ed Eukarya condividono un antenato comune, formando un clade chiamato "Tokaryotes" .
Mentre i batteri condividono anche alcune somiglianze con gli eucarioti, hanno una storia evolutiva fondamentalmente diversa. La stretta relazione tra Archaea ed Eukarya è supportata da una grande quantità di prove scientifiche ed è ampiamente accettata all'interno della comunità scientifica.
