* Ecologia microbica: Questo campo si concentra sulle interazioni tra i microrganismi e il loro ambiente, compresi i loro ruoli in ecosistemi, cicli biogeochimici e salute umana. Mentre la genetica svolge un ruolo nella comprensione della diversità e dell'adattamento microbici, l'obiettivo principale è sulla struttura della comunità, le interazioni e le funzioni dei microbi nei loro habitat naturali.
* Fisiologia microbica: Questo campo studia i processi metabolici e le funzioni dei microrganismi, incluso il modo in cui ottengono energia, sintetizzano componenti essenziali e rispondono ai cambiamenti ambientali. Mentre i geni controllano questi processi, l'attenzione è rivolta ai meccanismi biochimici e fisiologici, non necessariamente sul codice genetico specifico.
* Patogenesi microbica: Questo campo studia come i microrganismi causino malattie nell'uomo, negli animali e nelle piante. Mentre i fattori genetici sia nell'ospite che nel patogeno sono importanti, l'attenzione è rivolta ai meccanismi di infezione, alla risposta immunitaria e allo sviluppo di trattamenti.
* Microbiologia alimentare: Questo campo esamina il ruolo dei microrganismi nella produzione alimentare, nel deterioramento e nella sicurezza. Mentre l'analisi genetica può essere utilizzata per identificare i patogeni di origine alimentare, l'obiettivo principale è sul controllo microbiologico della qualità e della sicurezza degli alimenti.
* Microbiologia industriale: Questo campo utilizza microrganismi per la produzione di vari prodotti, tra cui prodotti farmaceutici, additivi alimentari e biocarburanti. Mentre la manipolazione genetica viene spesso utilizzata per ottimizzare i processi microbici, l'attenzione è rivolta all'applicazione pratica del metabolismo e della funzionalità microbica.
È importante notare che tutti I campi della microbiologia sono alla fine collegato alla genetica. Tuttavia, l'obiettivo specifico di questi campi si trova in aree oltre la semplice composizione genetica di una cellula.