1. Analisi del collegamento:
* Frequenza di ricombinazione: Questa è la pietra angolare della mappatura genetica.
* Come funziona:
* Durante la meiosi, i cromosomi scambiano materiale genetico (attraversamento) creando nuove combinazioni di alleli.
* Più due geni sono su un cromosoma, meno è probabile che vengano separati attraversando.
* La frequenza di ricombinazione (quanto spesso i geni sono separati) è direttamente correlata alla distanza tra loro.
* Dati: È necessario analizzare la prole dalle croci per determinare la frequenza di ricombinazione tra coppie di geni.
2. Mappatura fisica:
* Le distanze fisiche sono misurate in coppie di basi. Questo metodo analizza direttamente le sequenze di DNA.
* Tipi di dati:
* Polimorfismi di lunghezza del frammento di restrizione (RFLP): Differenze nella sequenza del DNA che influenzano laddove gli enzimi di restrizione tagliano il DNA.
* Polimorfismi a singolo nucleotide (SNP): Variazioni a coppia a base singola nelle sequenze di DNA.
* Microsatelliti: Sequenze di DNA ripetitive che variano in lunghezza, fornendo marcatori per la mappatura fisica.
* Dati di sequenza: Sequenziamento diretto del DNA per determinare l'ordine esatto dei nucleotidi.
3. Altre tecniche:
* Banding cromosomico: Questo metodo utilizza i coloranti per visualizzare i modelli di banda sui cromosomi. Sebbene non preciso, può fornire posizioni generali per i geni all'interno delle regioni cromosomiche.
* Ibridazione in situ fluorescenza (pesce): Le sonde fluorescenti bersaglio sequenze di DNA specifiche. Ciò consente di visualizzare dove si trova un gene su un cromosoma.
Considerazioni chiave:
* Risoluzione: La mappatura fisica fornisce posizioni geniche più precise rispetto all'analisi del collegamento.
* Tecniche complementari: Spesso, viene utilizzata una combinazione di approcci per ottenere una comprensione più completa delle posizioni geniche.
Esempio:
Immagina di mappare tre geni (A, B e C) su un cromosoma.
* Analisi del collegamento: Potresti scoprire che il gene A e il gene B si ricombino ad una frequenza del 10%, mentre il gene B e il gene C si ricombino ad una frequenza del 2%. Ciò suggerisce che A e B sono più distanti di B e C.
* Mappatura fisica: È quindi possibile sequenziare la regione del DNA contenente questi geni e scoprire che A e B sono separati da 100.000 coppie di basi, mentre B e C sono separate da 20.000 coppie di basi. Ciò conferma le distanze relative stabilite attraverso l'analisi del collegamento.
Fammi sapere se desideri maggiori dettagli su uno di questi metodi o hai ulteriori domande!
