La differenza più ovvia tra cellule procariotiche ed eucariotiche è la presenza di un nucleo .

* Cellule eucariotiche avere un vero nucleo racchiuso da una membrana, che ospita il loro DNA.

* Cellule procariotiche Manca un nucleo e il loro DNA si trova in una regione chiamata nucleoide , che non è racchiuso da una membrana.

Questa differenza nell'organizzazione del DNA è fondamentale e porta a molte altre differenze nella struttura e nella funzione di questi due tipi di cellule.