1. Classificazione filogenetica (basata su relazioni evolutive):
* 16s sequenziamento del gene rRNA: Questo metodo confronta le sequenze del gene RNA ribosomiale 16S, un gene altamente conservato presente in tutti gli organismi viventi. Le differenze nella sequenza genica rivelano relazioni evolutive tra archaea.
* Altri marcatori molecolari: Gli scienziati usano anche altri geni, come quelli coinvolti nel metabolismo energetico, per perfezionare ulteriormente la classificazione.
2. Classificazione metabolica (basata su fonti energetiche e metabolismo):
* Methanogens: Produrre metano come sottoprodotto del loro metabolismo e si trovano in ambienti anaerobici.
* Halophiles: Prosperare in ambienti altamente salati come laghi sale e saline.
* termofili: Sopravvivi in ambienti estremamente caldi come sorgenti termali e prese d'aria idrotermali.
* Acidophiles: Preferisci ambienti acidi.
* alcalofili: Prosperare in ambienti alcalini.
3. Caratteristiche cellulari:
* Composizione della parete cellulare: Gli arcai hanno pareti cellulari uniche diverse da quelle dei batteri. Alcuni archaea hanno pareti cellulari composte da pseudopeptidoglicano o addirittura mancano del tutto le pareti cellulari.
* Lipidi di membrana: Gli archaea possiedono lipidi di membrana unici diversi da quelli dei batteri ed eucarioti.
4. Fattori ambientali:
* Habitat: Gli archaea si trovano in una vasta gamma di ambienti, tra cui ambienti estremi come sorgenti termali, laghi di sale e prese d'aria in acque profonde.
Il sistema di classificazione corrente per Archaea riconosce due Phyla principale:
* Euryarchaeota: Include metanogeni, alfili e termofili.
* Crenarchaeota: Contiene molti termofili e acidophili.
Sono stati identificati anche altri phyla più piccoli, tra cui:
* thaumarchaeota
* Nanoarchaeota
* Korarchaeota
* aigarchaeota
La classificazione dell'archaea si evolve in costante evoluzione man mano che vengono scoperte nuove specie e vengono acquisite nuove informazioni sulle loro relazioni evolutive e capacità metaboliche.
Nota: Il termine "Archaebacteria" è obsoleto e non più usato dagli scienziati. Il termine corretto è archaea .
