Calcolo D esteso e applicazione alla condivisione di alleli specifici Direkli4. (A) Statistica D estesa. Per controllare il flusso genico con il genere Capra, condizioniamo varianti derivate in Direkli4 (H3) e un genoma X (H2), ma ancestrali in altre popolazioni (qui:pecore, genomi Capra non bezoari, bezoari della grotta di Direkli e altro bezoar). I valori sono calcolati rispetto a un insieme di capre neolitiche dei monti Zagros e normalizzati in modo simile alla statistica D. (B) Valori statistici D estesi per Direkli4 utilizzando trasversioni, (C) tracciati nel tempo. Ogni simbolo è un genoma di prova, la cui forma indica un periodo di tempo. I bordi neri indicano una |Z| punteggio ≥3, utilizzando 1000 repliche bootstrap e blocchi da 5 Mb. Credito:eLife (2022). DOI:10.7554/eLife.82984
I genetisti del Trinity College di Dublino, insieme a un team di collaboratori internazionali, hanno scoperto un lignaggio precedentemente sconosciuto di capre selvatiche di oltre dieci millenni. La ricerca è stata appena pubblicata sulla rivista eLife .
Il nuovo tipo di capra, scoperto dallo screening genetico dei resti ossei e denominato "il taurasian tur", probabilmente è sopravvissuto all'ultimo massimo glaciale (l'era glaciale), che ha arenato i suoi antenati sulle alte vette dei monti Taurus in Turchia, dove i loro sono stati trovati resti.
Una scoperta casuale alla grotta di Direkli
Oltre 12.000 anni fa, i cacciatori-raccoglitori nelle montagne del Tauro, nel sud della Turchia, facevano molto affidamento sulla selvaggina locale per cibo e sussistenza. Situata vicino all'attuale villaggio di Döngel e ad un'altitudine di ~ 1.100 m sul livello del mare, la grotta di Direkli è stata utilizzata per circa tre millenni (~ 14.000-11.000 anni fa) come campo stagionale per questi cacciatori e potrebbe essere stata abitata l'anno -il giro.
"Tra i reperti trovati nella grotta di Direkli c'erano grandi quantità di resti ossei con segni di lavorazione distinti, a indicare che le capre selvatiche venivano macellate lì per il consumo", afferma il dottor Kevin Daly, della Trinity's School of Genetics and Microbiology, che è il primo autore del libro ricerca articolo.
"Con la grotta circondata da alte vette, che raggiunge i circa 2.200 m, la capra selvatica o lo stambecco bezoario (Capra aegagrus) che abitano la regione oggi erano probabilmente l'obiettivo di questi cacciatori del tardo Pleistocene".
Durante lo screening genetico dei resti di ossa di capra di Direkli, i genetisti hanno notato qualcosa di insolito:molte capre portavano genomi mitocondriali simili a una diversa specie di capra selvatica.
Mentre la capra domestica deriva dallo stambecco bezoar, altre specie di capra selvatica sono ancora vive oggi e si trovano in regioni relativamente ristrette. Questi includono il tur del Caucaso orientale e occidentale, due specie sorelle (o sottospecie) di capra selvatica che ora si trovano solo nelle montagne del Caucaso in Georgia. Molti dei campioni della grotta di Direkli trasportavano mitocondri legati a questi tur del Caucaso, nonostante la grotta di Direkli si trovasse a circa 800 km dal loro attuale habitat.
Il dottor Daly aggiunge che "una sorpresa ancora più grande è arrivata quando abbiamo esaminato i genomi nucleari delle capre della grotta di Direkli:mentre la maggior parte assomigliava allo stambecco bezoario, come previsto, un campione sembrava diverso dal resto. Questo campione, Direkli4, mostrava una genetica più ancestrale varianti rispetto ad altre capre Direkli, indicando che potrebbe essere stata una specie diversa dalle altre".
Per capire meglio questo, il team del Trinity ha collaborato con i ricercatori del Muséum national d'Histoire naturelle di Parigi per generare dati genetici da altre specie del gruppo Capra.
Una nuova stirpe di Tur
Il team è stato sorpreso di vedere che il campione Direkli4 si è effettivamente raggruppato con il tur caucasico, che sembra essere un gruppo gemello sia del tipo orientale che di quello occidentale. Incuriosito, il team ha esaminato più materiale dalla grotta di Direkli e ha trovato altri due campioni con un genoma "simile a tur", suggerendo che una popolazione di questi parenti tur viveva nelle montagne del Tauro vicino allo stambecco bezoar locale, con entrambi cacciati dagli umani in tempi preistorici.
Il team suggerisce un nome per il tur Taurasian scoperto:Capra taurensis o Capra caucasica taurensis; i ricercatori classificano ancora il tur vivente come sottospecie o due specie distinte.
Poiché i tur sono più grandi e più pesanti di altre capre selvatiche, con una caratteristica forma a corno, dovrebbe essere possibile identificare un gruppo di parenti tur nei resti di animali. I resti di corno sono assenti nella grotta di Direkli, nonostante il gran numero di resti, probabilmente indicando che questi sono un prezioso premio tra i cacciatori. Ma gli archeologi del team hanno mostrato che c'erano molte capre di grosso corpo nella grotta di Direkli e forse in altre località montuose del sud-ovest asiatico.
"Ci auguriamo che questo incoraggi la rivalutazione e l'analisi dei resti faunistici nella regione poiché potrebbero esserci ancora alcune scoperte interessanti da trovare", ha aggiunto il dottor Daly.
Vittima del cambiamento climatico e dell'attività umana?
Il team suggerisce che gli antenati di tur abbiano vissuto in un'area geografica più ampia negli ultimi 100.000 anni, dalle montagne del Caucaso alle montagne del Tauro dal Mediterraneo, e che il cambiamento climatico potrebbe aver causato la frammentazione dell'habitat.
Il dottor Daly afferma che "l'ultimo massimo glaciale, o era glaciale, potrebbe aver reso inospitali molte aree, costringendo queste capre a competere con altre specie. Il tur taurasiatico potrebbe essere stato un gruppo avanzato, limitato alle vette dei Monti del Tauro. L'aumento dell'attività umana avrebbe esercitato ulteriore pressione sul tur taurasiatico, con la caccia evidenziata nella grotta di Direkli."
"Anche se non sappiamo esattamente quando o come questo lignaggio di capre si sia estinto, ulteriori indagini genomiche nella regione potrebbero mostrare che i loro genomi sopravvivono nelle capre selvatiche di oggi". + Esplora ulteriormente
