1. Promotori:
* Promotore principale: La sequenza minima richiesta per l'RNA polimerasi II per legare e avviare la trascrizione. In genere include la scatola Tata e l'elemento iniziatore.
* Elementi promotori prossimali: Situati a monte del promotore di base, influenzano l'efficienza dell'inizio della trascrizione. Gli esempi includono la casella CAAT e la scatola GC.
2. Postatori:
* Elementi regolamentari distali: Queste sequenze possono essere posizionate a migliaia di coppie di basi lontano dal gene che regolano, anche in introni o altri geni.
* Modulare: I potenziatori possono essere assemblati in diverse combinazioni per perfezionare l'espressione genica.
* specifico del tessuto: Alcuni potenziatori sono attivi solo in specifici tipi di cellule, contribuendo alla differenziazione e alla specializzazione delle cellule.
3. Silenziatori:
* Elementi regolamentari negativi: Leggono le proteine del repressore che inibiscono la trascrizione.
* dipendente dal contesto: La loro attività può essere influenzata da altri elementi regolatori e fattori ambientali.
4. Isolanti:
* Elementi al contorno: Impediscono la diffusione dei segnali regolamentari da esaltatori o silenziatori ai geni vicini.
* Organizzazione del dominio: Gli isolanti contribuiscono alla compartimentazione della cromatina, garantendo che gli elementi regolatori influenzino solo i loro geni target.
5. Isole CPG:
* Regioni arricchite in CPG Dinucleotides: Si trovano spesso nei promotori e sono soggetti a metilazione.
* Regolazione mediante metilazione: La metilazione delle isole CPG può mettere a tacere l'espressione genica, mentre la demetilazione può attivare la trascrizione.
6. Segnali di poliadenilazione (PAS):
* Sequenze che segnalano la fine della trascrizione: Segnano il sito in cui il pre-mRNA è scisso e poliadenilato.
* Controllo post-trascrizionale: La sequenza PAS influenza la stabilità e la traduzione dell'mRNA.
7. Elementi di giunzione intronici:
* Sequenze all'interno di introni che regolano la giunzione: Influenzano la rimozione degli introni dal pre-mRNA.
* Splicing alternativo: Questi elementi contribuiscono alla produzione di più isoforme proteiche da un singolo gene.
8. Siti target di MicroRNA:
* Sequenze negli mRNA che sono riconosciuti dai microRNA: I miRNA possono legarsi ai siti target e reprimere la traduzione o promuovere la degradazione dell'mRNA.
* Silenziamento del gene post-trascrizionale: I miRNA svolgono ruoli cruciali nella regolazione dell'espressione genica durante lo sviluppo, la differenziazione cellulare e la malattia.
Queste sono solo alcune delle principali sequenze di DNA coinvolte nella regolazione genica nelle cellule eucariotiche. L'interazione intricata di queste sequenze con proteine regolatori crea una rete regolatoria complessa e dinamica che consente alle cellule di rispondere a diversi segnali ambientali e mantenere l'omeostasi cellulare.
