I batteri eterotrofici neutrofili e acidofili costituiscono la maggior parte delle specie di batteri. I termini "neutrofilo" e "acidofilo" indicano il livello ottimale di pH delle specie batteriche - una misura dell'acidità o basicità di una sostanza. Ad esempio, l'aceto misura come acido e il bicarbonato di sodio come base. La scala del pH varia da 0 a 14, con 7, il pH dell'acqua pura, proprio nel mezzo.
Eterotrofi neutrofili
La maggior parte dei batteri, dei neutrofili, vivono nel suolo o nell'acqua e crescere meglio a un pH neutro tra 6 e 8. Se il pH varia troppo al di fuori di questo intervallo, i batteri neutrofili non possono sopravvivere. La maggior parte dei batteri che causano malattie negli esseri umani sono anche eterotrofi neutrofili, adatti per sopravvivere all'interno di un corpo umano.
Eterotrofi acidofili
I batteri acidofili crescono meglio a bassi livelli di pH, solitamente sotto un pH di 6, in quanto hanno meccanismi biologici che consentono loro di mantenere il loro pH interno vicino neutro. Il drenaggio acido delle miniere - il deflusso contaminato e altamente acido delle aree minerarie - contiene un'alta popolazione di acidofili che ossidano il solfuro presente nei minerali metalliferi. Secondo il Science Resource Center del Carleton College, il ferroplasma acidofilo trovato nel drenaggio delle miniere di acido mostrava livelli di pH bassi come zero.
Eterotrofio obbligatorio degli acidi eterotropici
Gli acidofili obbligatori richiedono un pH basso, inferiore 4 o 5, per sopravvivere. La membrana cellulare degli acidofili obbligati si dissolve in realtà a livelli di pH neutri, provocando la morte cellulare. Molti acidofili obbligati sono anche termofili - organismi che crescono meglio a temperature elevate - e che si trovano comunemente nei terreni vulcanici. Il ferrocromo del thiobacillus è probabilmente il batterio acidofilo più ossidante per il ferro più studiato.