Uno studio multidisciplinare del Computer Biochemistry Research Group dell'Universitat Jaume I (UJI) e collaboratori ha progettato piccole molecole in grado di legarsi e inibire l'attività degli enzimi nelle malattie infettive. Le conclusioni di questo lavoro, sviluppato insieme alla Simon Fraser University di Saint Andrews, sono stati pubblicati sulla rivista Comunicazioni sulla natura .
La ricerca ha mostrato come nuove molecole, simile ai carboidrati ma più piccolo, legame con gli enzimi responsabili della loro degradazione, glucosidasi. "Abbiamo sintetizzato nuove molecole, prese nuove misurazioni della loro attività inibitoria, strutture ottenute tramite diffrazione di raggi X e quindi simulazioni al computer condotte sull'intero processo, " spiega il capo del gruppo Computer Biochemistry, Vicente Moline. I risultati hanno mostrato la capacità di queste nuove molecole di inibire l'attività di questo specifico tipo di enzimi glicosidici.
Molino, professore di Chimica Fisica presso l'UJI, ritiene che questo studio "può rappresentare il primo passo per la progettazione di nuovi farmaci, " poiché i glicosidi non sono solo enzimi essenziali per digerire i carboidrati, ma sono anche attori chiave nelle infezioni causate da agenti patogeni, nella difesa antibatterica e in molti altri processi cellulari vitali.
I dati ottenuti attraverso simulazioni al computer coincidono con i dati sperimentali dei loro colleghi in Canada e nel Regno Unito e permettono di spiegare come questi inibitori si legano all'enzima. "Lo studio ha permesso di descrivere a livello molecolare come inibire l'attività di un importante tipo di enzimi, glicosidi. Il tipo di unione tra queste molecole e l'enzima è molto forte, così possano essere il seme di nuove medicine, "dice Moline.
Collaborazione sperimentale e teorica
"La collaborazione tra gruppi sperimentali e teorici è, come ha recentemente evidenziato l'Accademia svedese delle scienze durante la cerimonia di consegna del premio Nobel, il pilastro per lo sviluppo della conoscenza. Per di più, è fondamentale per i ricercatori stessi, in quanto consente loro di unire i pezzi del puzzle che sono i tanti risultati di diversi laboratori, " aggiunge ricercatore dello stesso gruppo UJI, Katarzyna Świderek.
Vicent Moliner è professore di chimica fisica presso l'Universitat Jaume I e capo ricercatore del Computer Biochemistry Group. La dottoressa Katarzyna Świderek è ricercatrice nello stesso gruppo con un contratto Juan de la Cierva, assegnato dal Dipartimento di Scienze, Innovazione e Università. Il gruppo sviluppa e applica metodi teorici per lo studio dei processi biologici attraverso simulazioni con computer ad alte prestazioni. Recentemente, questo gruppo UJI ha rivelato come funzionano gli enzimi nei sistemi legati ai processi degenerativi come il morbo di Alzheimer.
