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Molti prodotti farmaceutici agiscono prendendo di mira i cosiddetti "recettori accoppiati a proteine G". In un nuovo studio, scienziati dell'Università di Uppsala descrivono come sono stati in grado di prevedere come le molecole speciali che possono essere utilizzate nella nuova immunoterapia contro il cancro si legano a questi recettori. I metodi di calcolo dei ricercatori, presentato sulla rivista Angewandte Chemie sono un contributo vitale alla futura progettazione di farmaci basati sulla struttura.
I recettori accoppiati a proteine G (GPCR) sono tra i gruppi target di proteine di maggiore importanza per lo sviluppo di farmaci. Questi recettori reagiscono a, Per esempio, leggero, sapori, odori, adrenalina, istamina, dopamina e un lungo elenco di altre molecole trasmettendo ulteriori segnali biochimici all'interno delle cellule. I ricercatori che hanno condotto l'indagine sui GPCR sono stati premiati con il Premio Nobel per la Chimica nel 2012.
Oggi, circa il 30 percento di tutti i farmaci sul mercato ha GPCR come proteine bersaglio. Alcune molecole di farmaci, come la morfina, attivano i recettori (agonisti) mentre altri, come i beta-bloccanti, inattivarli (antagonisti).
Un importante GPCR è il recettore A2A dell'adenosina. I suoi antagonisti possono essere utilizzati nella nuova immunoterapia contro il cancro. Insieme alla società biofarmaceutica Sosei-Heptares, i ricercatori Willem Jespers, Johan Åqvist e Hugo Gutierrez-de-Terán dell'Università di Uppsala sono riusciti a mostrare come una serie di antagonisti A2A si leghino al recettore e lo inattivino.
Con simulazioni di dinamica molecolare e calcolo delle energie di legame, è diventato possibile prevedere come le molecole dell'azienda farmaceutica si legherebbero ai recettori e con quale forza lo fanno. Successivamente, sono stati progettati nuovi antagonisti, e sintetizzato da chimici dell'Università di Santiago de Compostela, Spagna. Le strutture tridimensionali dei complessi che si formano tra queste molecole e il recettore sono state quindi determinate sperimentalmente con la cristallografia a raggi X. I calcoli al computer si sono dimostrati in grado di prevedere sia la struttura che la forza di legame nei complessi con elevata precisione.
"Questo è un solido passo avanti, e siamo riusciti a prevedere con grande precisione come questa famiglia di molecole leghi il recettore A2A. I nostri metodi di calcolo stanno ora avendo un importante passo avanti nella progettazione di farmaci basata sulla struttura, "dice Hugo Gutierrez-de-Terán, che ha guidato il progetto del gruppo Uppsala.