I dispositivi portatili sono adatti al monitoraggio ambientale durante la produzione alimentare, e presentano vantaggi chiave nella facilità d'uso e nell'identificazione di un'ampia varietà di batteri, secondo un nuovo studio pubblicato sulla rivista npj Scienza del cibo .

Lo studio, dai ricercatori del Teagasc Food Research Program e dell'APC Microbiome Ireland SFI Research Centre, è il primo a testare i sequenziatori di DNA portatili come soluzione di monitoraggio microbico di routine per gli impianti di produzione alimentare.

Identificare i microbi presenti nel nostro cibo è importante. Dopotutto, possono causare deterioramento e malattie del cibo, quindi i controlli di routine sulla vita microbica negli impianti di produzione alimentare sono una necessità. Però, tecniche attuali per raggiungere questo obiettivo, mentre provato e testato, avere alcune limitazioni.

"I test microbiologici nella catena alimentare hanno, e continua a, fare affidamento su anziani, test microbiologici classici come l'uso di agar e piastre di Petri, " ha spiegato l'autore senior dello studio, Professor Paul Cotter. "Questo è un approccio che richiede tempo e vengono identificati solo i microrganismi che vengono specificamente testati".

Il sequenziamento del DNA offre un'alternativa. Invece di coltivare campioni batterici in piastre di Petri, può analizzare rapidamente il DNA batterico e identificare le specie in un campione. La presa? Il sequenziamento convenzionale del DNA comporta costose apparecchiature di laboratorio e solo tecnici di laboratorio altamente qualificati possono eseguire la procedura e analizzare i risultati.

Questa non è una buona soluzione per la sorveglianza microbica di routine negli impianti di produzione alimentare affollati. Una tecnologia più recente offre il sequenziamento rapido del DNA con un dispositivo portatile di facile utilizzo, ma nessuno aveva testato il suo potenziale nella produzione alimentare, fino ad ora. Professor Cotter e colleghi, guidato dalla dottoressa Aoife McHugh, ha deciso di indagare in che modo tale tecnologia di sequenziamento portatile si sarebbe confrontata con il sequenziamento in laboratorio, utilizzando campioni di tampone da un caseificio funzionante.

Sorprendentemente, il dispositivo portatile si è rivelato simile al più grande sistema di sequenziamento basato su laboratorio in termini di numero di specie batteriche che poteva identificare nei campioni, suggerendo che ha un potenziale come dispositivo di monitoraggio di routine nella produzione alimentare. Però, il piccolo dispositivo richiede una quantità minima di DNA prima di poter funzionare correttamente.

Nel caseificio ben pulito semplicemente non c'erano abbastanza batteri in molti dei campioni, quindi i ricercatori hanno dovuto eseguire un ulteriore passaggio per amplificare il DNA batterico prima che ce ne fosse abbastanza da analizzare. Questo è un piccolo ostacolo, e ulteriori sviluppi con la tecnologia possono aiutare a superarlo.

"Come microbiologi, l'uso del sequenziamento del DNA ha rivoluzionato la nostra comprensione delle affascinanti comunità microbiche sul fondo degli oceani, le cime degli iceberg e una vasta gamma di altri ambienti, " ha affermato il professor Cotter. "Anche se tali studi hanno il potenziale per avere un impatto sulla nostra vita a lungo termine, l'uso di queste tecnologie per migliorare la qualità e la sicurezza degli alimenti può avere un impatto molto rapido sulla vita di tutti i giorni. Questo studio rappresenta un passo fondamentale verso un giorno in cui i non esperti possono utilizzare gli strumenti di sequenziamento del DNA per eseguire test microbiologici nella catena alimentare".