La configurazione elettronica dello stato fondamentale di un atomo neutro di manganese è [Ar]3d^54s^2. Ciò significa che l'atomo di manganese ha 25 elettroni, con i primi 18 elettroni che riempiono i livelli interni (1s, 2s, 2p, 3s e 3p) e i restanti 7 elettroni che riempiono i sottolivelli 3d e 4s. Il subshell 3d è parzialmente pieno, con cinque elettroni, mentre il subshell 4s è completamente pieno, con due elettroni.