Tuttavia, in realtà, la composizione dei minerali fluorite può discostarsi da questa formula ideale a causa della sostituzione degli ioni calcio con altri cationi, come ittrio, cerio o stronzio. Inoltre, possono esserci variazioni nella presenza di fluoro e nel minerale possono essere presenti anche impurità come anidride carbonica, idrocarburi o elementi di terre rare. Queste deviazioni e variazioni danno luogo a varietà e colorazioni distinte di fluorite.