Il numero di atomi di idrogeno rispetto agli atomi di ossigeno in un amminoacido può variare a seconda dell'amminoacido specifico. Tuttavia, in media, gli amminoacidi contengono tipicamente più atomi di idrogeno rispetto agli atomi di ossigeno. Questo perché la struttura amminoacidica è costituita da un atomo di carbonio centrale legato a un gruppo amminico (-NH2), un gruppo carbossilico (-COOH), una catena laterale (R) e un atomo di idrogeno. Il gruppo amminico contiene due atomi di idrogeno, mentre il gruppo carbossilico contiene un atomo di ossigeno. La catena laterale (R) può variare nella struttura e nella composizione e può fornire ulteriori atomi di idrogeno.

Ad esempio, la glicina, l'amminoacido più semplice, ha la formula NH2-CH2-COOH. Contiene quattro atomi di idrogeno e due atomi di ossigeno. D'altra parte, l'asparagina, un altro amminoacido, ha la formula NH2-CH(CH2-CONH2)-COOH. Contiene otto atomi di idrogeno e tre atomi di ossigeno.

In generale, gli amminoacidi tendono ad avere un rapporto più elevato tra atomi di idrogeno e atomi di ossigeno a causa della presenza di atomi di idrogeno nel gruppo amminico e nelle catene laterali variabili. Tuttavia, il numero esatto di atomi di idrogeno e ossigeno può variare tra i diversi amminoacidi.