Ecco perché:

* Legame idrogeno: La guanina (G) e la citosina (C) formano tre legami idrogeno tra loro, mentre l'adenina (A) e la timina (T) formano solo due legami idrogeno.

* Interazioni di impilamento: Le basi planari in DNA si accumulano l'una sull'altra. Le coppie GC hanno interazioni di impilamento più efficienti a causa della loro superficie più ampia e interazioni idrofobiche più forti.

* Stabilità: Il legame idrogeno più forte e le interazioni di impilamento più favorevoli nelle coppie GC contribuiscono a una stabilità complessiva più elevata della molecola di DNA.

Pertanto, un contenuto di GC più elevato porta a una temperatura di fusione più elevata.

Implicazioni pratiche:

* PCR: Nella reazione a catena della polimerasi (PCR), i primer con contenuto GC più elevati sono spesso preferiti perché hanno una TM più elevata, che può migliorare la specificità e l'efficienza della reazione.

* Ibridazione del DNA: Un maggiore contenuto di GC nelle sonde utilizzate per l'ibridazione del DNA può aumentare la loro affinità di legame e la loro specificità.

* Genomica: Le regioni del genoma con alto contenuto di GC sono spesso associate a regioni ricche di geni e hanno un livello più elevato di attività trascrizionale.

In sintesi, il DNA ricco di GC è più stabile del DNA ricco di AT e quindi ha una temperatura di fusione più elevata.