Ecco perché:
* Northern Blotting utilizza un gel di agarosio, non un gel di poliacrilammide. I gel di poliacrilammide sono usati in SDS-PAGE (elettroforesi gel di poliacrilammide dodecil solfato di sodio), che separa le proteine per dimensioni. La formaldeide viene utilizzata in alcuni protocolli SDS-PAGE per mantenere l'integrità della struttura proteica.
* Blotting Northern bersaglio RNA, non proteine. L'RNA è separato per dimensioni usando un gel di agarosio, non un gel di poliacrilammide. La formaldeide non è necessaria per mantenere la struttura dell'RNA in questo contesto.
ecco cosa viene usato nella preparazione del gel blotting settentrionale:
* agarosio: Un polisaccaride che forma una matrice in gel, separando le molecole di RNA per dimensione.
* Buffer: Tipicamente Tris-Borato-EDTA (TBE) o Tris-Acetato-EDTA (TAE) tampone, fornendo un mezzo conduttivo per l'elettroforesi.
* formaldeide (opzionale): La formaldeide viene * a volte * aggiunta al tampone di elettroforesi durante la macchia settentrionale, ma questo non è per preparare il gel stesso. Viene utilizzato per denigrare le molecole di RNA, garantendo che migrano attraverso il gel in base alla sola dimensione, non sulla struttura.
In sintesi: La formaldeide non svolge alcun ruolo nella preparazione del gel blotting settentrionale. È usato in alcuni protocolli per denatura delle molecole di RNA durante l'elettroforesi, ma non nel gel stesso.
