Se messo in acqua, un aminoacido lo farà:
* ionize: Il gruppo carbossilico perderà un protone (H+), diventando carico negativamente (COO-), mentre il gruppo amminico guadagnerà un protone, diventando carico positivamente (NH3+). Questo perché il gruppo carbossilico è acido e il gruppo amminico è di base.
* Comportati come Zwitterion: Una zwitterion è una molecola che ha una carica sia positiva che negativa. A causa delle sue doppie cariche, l'amminoacido sarà in grado di interagire con molecole polari e non polari in acqua.
* Formare legami idrogeno: I gruppi carichi sull'amminoacido saranno in grado di formare legami idrogeno con le molecole d'acqua, rendendolo solubile.
Nel complesso, un aminoacido posto in acqua fungerà da zwitterion , essendo solubile e in grado di interagire con ambienti sia polari che non polari.