L'area sotto la curva di progressione della malattia (AUDPC) è una misura quantitativa dell'intensità della malattia nel tempo. È usato nella patologia vegetale per indicare e confrontare i livelli di resistenza alle malattie tra varietà di piante. Il metodo trapezoidale è il modo più comune per calcolare l'AUDPC. Viene eseguita utilizzando una formula ideata da Campbell e Madden nel 1990 o tracciando un grafico di percentuale dell'infezione contro il tempo e sommando i trapezi tra intervalli di tempo.

Misura la progressione della malattia

Regole di ricerca e linee guida che si applicano alla misurazione della malattia specifica e del raccolto da indagare. La dimensione richiesta del campione vegetale varia in base a coltura e malattia. Studiare la peronospora tardiva in tuberi, ad esempio, richiede un campione minimo di 40 piante.

Pianta il numero appropriato di piante necessarie per lo studio.

Guarda attentamente i segni della malattia. Ricerca quando ci si aspetta che i segni si manifestino in modo da essere preparati. Ad esempio, i segni di tardiva rugosità si verificano circa 30-40 giorni dopo la semina e 10 giorni dopo l'ultima applicazione di fungicida.

Stimare visivamente la percentuale di area foglia infetta nel campione non appena si nota la malattia.

Registra la percentuale di area foglia infetta a intervalli di tempo regolari. I ricercatori prendono la lettura per la peronospora tardiva ogni sette giorni se la malattia progredisce più rapidamente del previsto. Le letture vengono prese ogni 14 giorni quando la progressione della malattia è più lenta.

Interrompi la registrazione delle misurazioni dell'infezione quando la percentuale di infezione smette di aumentare ei livelli di progressione della malattia.

Calcola AUDPC da un'equazione

Aggiungi le prime due percentuali di infezione registrate.

Dividi il risultato di addizione per due per trovare il valore medio o medio delle due letture.

Moltiplica il valore medio o medio dall'intervallo di tempo, che è il numero di giorni dalla prima lettura alla seconda lettura. Se hai preso la prima lettura il giorno 20 e la seconda lettura il giorno 27, ad esempio, il numero di giorni o intervallo di tempo è di sette giorni.

Registra il risultato in unità di giorni percentuale. Il valore è un'area di un trapezio.

Ripeti i passaggi da uno a quattro per la seconda e la terza lettura di infezione che hai preso. Il loro risultato sarà l'area di un secondo trapezio. Ripeti i passaggi da 1 a 4 fino a calcolare le aree trapezoidali per tutte le letture.

Aggiungi tutti i trapezi per trovare l'AUDPC. Gli AUDPC bassi rappresentano una progressione della malattia più lenta e una maggiore resistenza alla malattia. Gli AUDPC più alti rappresentano una più rapida progressione della malattia e una maggiore suscettibilità alla malattia.

Suggerimento

L'AUDPC si trova anche tracciando la percentuale di infezione contro il tempo su un grafico. L'area di ciascun trapezio tra le letture viene calcolata utilizzando una geometria semplice.

L'AUDPC consente di variare gli intervalli di tempo tra le letture, ma le letture dovrebbero iniziare subito dopo l'inizio della malattia. Un lungo ritardo produce materiali suscettibili che non fanno parte della curva di progressione della malattia.

Avvertenza

A causa della stima implicita nella valutazione della percentuale di infezione, l'AUDPC è considerata una variabile pseudo-quantitativa. L'AUDPC è solo una stima dell'area sotto l'effettiva curva di infezione.

L'AUDPC non è generalmente confrontabile tra gli esperimenti a causa di vari fattori come la presenza di condizioni avverse o favorevoli della malattia.