Nel diciannovesimo secolo, la tassonomia - la classificazione degli organismi viventi - era di gran moda in biologia. [Rif. 1] Entrambi i naturalisti dilettanti e professionisti erano così presi dalla mania di collezionare e identificare creature, i rari coleotteri erano prodotti caldi. [ref.2, circa a metà strada] All'epoca, si sapeva poco dei microrganismi e del loro posto nel mondo degli esseri viventi, quindi non ricevevano altrettanta attenzione. I decenni successivi hanno visto un drammatico aumento della conoscenza dei microbi, con parte di quell'aumento dimostrato dall'efficiente classificazione dei microrganismi.

Tassonomia

La tassonomia ha tre componenti: nomenclatura, classificazione e identificazione. La nomenclatura sta semplicemente assegnando un nome a una specie. La classificazione raggruppa le specie in base a caratteristiche condivise, alcune delle quali sono fisiche e alcune biochimiche. L'identificazione utilizza le caratteristiche di un organismo per determinare dove appartiene a uno schema di classificazione. Lo schema tassonomico moderno ha come il suo gruppo più ampio e inclusivo i domini. Il gruppo più piccolo è la specie. Dal più inclusivo al più specifico, i livelli corrono in questo modo: dominio, regno, phylum, classe, ordine, famiglia, genere e specie. Tu, ad esempio, sei Eukarya Animalia Chordata Mammalia Primate Hominidae Homo sapiens.

Microorganismi e domini

I microrganismi sono estremamente diversi. Non sono definiti da alcun tipo particolare di struttura o funzione, ma semplicemente dalla loro dimensione. I microorganismi sono così diversi che rientrano in tutte e tre le diverse classificazioni di alto livello: tutti e tre i domini. Un dominio è batteri, l'altro è archaea e il finale è eukarya. Tutti i membri dei domini di batteri e archaea sono microrganismi monocellulari. Sono entrambe le cellule senza membrane che separano il loro materiale genetico dal resto della cellula - le membrane che definiscono un nucleo. Quindi tutti i regni, i phyla, le classi, gli ordini, le famiglie, i generi e le specie all'interno dei domini di batteri e archaea sono microrganismi.

Protisti

Gli eucari sono organismi le cui cellule contengono un nucleo. Molti organismi eucarioti sono microrganismi monocellulari, ma molti altri - come gli alberi di sequoia o voi - non lo sono. Quindi sono necessarie ulteriori classificazioni. Il regno Protista all'interno del dominio Eukarya è composto solo da microrganismi unicellulari. I protisti sono divisi in tre diversi gruppi di phyla: quattro diversi phyla di alghe, quattro diversi phyla di protozoi e due diversi phyla di muffa. Ma tutti gli organismi all'interno di questi phyla - tutti all'interno del regno Protista - sono microrganismi.

Funghi

Il regno Fungi è contenuto nel dominio Eukarya. Alcuni dei phyla all'interno dei funghi contengono microrganismi. Ad esempio, il phylum Zygomycota contiene muffe microscopiche per il pane e il phylum Ascomycota contiene lieviti e parassiti e parassiti delle colture microbiche. I licheni sono un assemblaggio simbiotico di un fungo e un organismo fotosintetico - contenuti in parte nel regno Fungi e in parte in altri regni, o anche in altri domini.