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    L'approccio al data mining rivela che le collaborazioni sono la chiave per le scoperte farmaceutiche

    L'immagine sopra, Fig. 2 dalla carta, è stato generato utilizzando Cytoscape, uno strumento Open Source finanziato dal National Institute of Health (NIH) degli Stati Uniti. Attestazione:Elsevier

    La ricerca di base può portare a cure, farmaci e altre scoperte scientifiche attraverso la collaborazione, conferma un nuovo studio a Heliyon (www.heliyon.com/). Comprendere la portata della collaborazione che porta a scoperte rivoluzionarie potrebbe aiutare gli istituti di ricerca a pianificare e valutare i propri sforzi di collaborazione.

    Gli autori del nuovo studio, da NET ESOLUTIONS Corporation (NETE), Istituti Gladstone, UCSF, e Elsevier, combinato data mining con tecniche investigative vecchio stile per capire cosa ha portato allo sviluppo di cinque principali farmaci antitumorali. I loro risultati rivelano come la collaborazione nella ricerca, sovvenzioni e pubblicazioni combinate per rendere possibili i farmaci.

    "Penso che il nostro lavoro serva a ricordare che la scienza di base ha preceduto e influenzato queste scoperte traslazionali attraverso la collaborazione, " ha detto l'autore corrispondente Dr. George Chacko di NETE. "Il finanziamento pubblico della ricerca di base ha molti vantaggi traslazionali; la natura intrinsecamente collaborativa della scoperta scientifica porta a scoperte".

    Nello studio, i ricercatori hanno utilizzato farmaci antitumorali come casi di studio per la loro metodologia. Hanno estratto dati da fonti di dati pubbliche e commerciali, tra cui:studi clinici; documenti della Food and Drug Administration (FDA); domande di brevetto; domande di sovvenzione; e articoli sottoposti a revisione paritaria su Scopus (www.scopus.com/home.uri) e PubMed.

    Per mappare la storia dello sviluppo di cinque farmaci - Imatinib, sunitinib, Nelarabina, Ramucirumab e Alemtuzumab (Campath):il team ha identificato più di 235 ricercatori in cinque grandi reti, che ha prodotto collettivamente 106, 000 articoli sottoposti a revisione paritaria. Hanno analizzato le citazioni per identificare un nucleo di pubblicazioni citate in tutte le reti, comprese 14 pubblicazioni comuni a tutte e cinque le reti.

    "Siamo rimasti sorpresi (e deliziati) dal piccolo numero di pubblicazioni citate che erano comuni alle reti di collaborazione, e sorpreso di scoprire quanto fossero influenti nel plasmare il pensiero futuro, " ha commentato il dottor Chacko..

    I ricercatori affermano che il loro nuovo approccio può essere facilmente modificato ed esteso ad altre aree. Può essere utilizzato per documentare le vaste collaborazioni scientifiche che si verificano nel corso di molti anni e spaziano dalla ricerca di base a quella traslazionale, rivelando come la collaborazione si traduca in scoperta e innovazione a vantaggio del pubblico.

    Però, gli autori aggiungono due note di cautela. Bibliometria, centrale per lo studio, presenta limitazioni a causa delle diverse pratiche di citazione tra le discipline e della qualità dei dati. In secondo luogo, il team non è stato in grado di accedere ai record completi di finanziamento e revisione tra pari.

    "Per noi, questo documento è un passo verso l'obiettivo più ampio di essere in grado di documentare gli input nella scienza e mapparli su output e risultati. Studi come questo consentono una maggiore accessibilità e trasparenza e facilitano il lavoro su larga scala. I metodi digitali continueranno a consentire una maggiore trasparenza e una migliore scienza della valutazione, " ha detto il dottor Chacko.

    Lo studio stesso è il risultato di una collaborazione interistituzionale di successo, che ha richiesto al team un anno per essere costruita.

    "Siamo fortunati ad avere collaboratori così validi, " Il Dr. Chacko ha aggiunto. "La componente NETE di questa collaborazione era un esperimento mentale non finanziato che è stato condotto fuori orario - la sera, notti e nei fine settimana. Ora abbiamo dei fondi per estendere questo lavoro, che è molto utile e sono grato a NETE per aver supportato queste idee."


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