Ecco una ripartizione degli obiettivi del programma:
* Test della fattibilità del volo spaziale umano: Prima di Mercurio, nessuno sapeva se gli umani potessero sopravvivere alle dure condizioni dello spazio. Questo programma mirava a dimostrare che era possibile.
* Raccogli i dati sulle prestazioni umane nello spazio: Il programma ha cercato di raccogliere informazioni su come gli umani avrebbero reagito fisicamente e psicologicamente ai rigori dei viaggi nello spazio.
* Sviluppa le tecnologie necessarie per i viaggi nello spazio: Ciò includeva la progettazione e la costruzione di veicoli spaziosi, sistemi di supporto vitale e veicoli di lancio.
* Dimostra noi capacità tecnologica: Nel mezzo della guerra fredda, il programma Mercurio è stato visto come un grande passo verso la dimostrazione della superiorità tecnologica degli Stati Uniti sull'Unione Sovietica, che aveva già lanciato il primo satellite, Sputnik e il primo uomo nello spazio, Yuri Gagarin.
Il programma Mercury ebbe in definitiva successo, raggiungendo il suo obiettivo di mettere un uomo in orbita e restituirlo in sicurezza. Ha aperto la strada ai successivi programmi di volo spaziale umano, come Gemini e Apollo, che alla fine hanno ottenuto i primi umani sulla luna.