Le complesse reti di segnalazione utilizzate dai batteri per adattarsi ai loro ambienti sono diventate più chiare in seguito a nuove ricerche.

I ricercatori del John Innes Center hanno utilizzato uno studio sul batterio promotore della crescita delle piante Pseudomonas fluorescens per sviluppare un metodo di analisi avanzato che, essi sperano, aumenterà la nostra capacità di comprendere le malattie delle piante e dell'uomo.

Fino a poco tempo fa, le indagini sulla segnalazione batterica hanno avuto la tendenza a esaminare i diversi aspetti della regolazione genica isolatamente. Basandosi su questi approcci individuali, il team di John Innes ha utilizzato una serie di laboratori, tecniche computazionali e matematiche per integrare i dati ottenuti da molteplici esperimenti microbiologici differenti.

Questo approccio ha permesso loro di costruire una "mappa di segnalazione" completa per la proteina batterica chiave Hfq, che controlla la virulenza e le risposte allo stress in molte specie importanti dal punto di vista clinico e agricolo.

Dottor Jacob Malone, il leader del progetto associato al lavoro ha spiegato:"La nostra tecnica ci consente di seguire ogni gene e proteina in una cellula batterica, e dire come cambia e a che livello si verifica quel cambiamento, in risposta a un dato segnale in ingresso.

"Stiamo utilizzando gli stessi set di dati degli studi precedenti, ma abbiamo sviluppato un modo per integrare i dati utilizzando la matematica e la programmazione. Se si considerano i singoli elementi di un film:la fotografia, la colonna sonora e la sceneggiatura; combinandoli si ottiene un intero film, qualcosa di più grande della somma delle parti. Questo è lo stesso principio, solo con la genetica."

I risultati della squadra, pubblicato in Frontiere in microbiologia (Analisi del complesso panorama normativo di Hfq - un'integrazione, Approccio multi-omico, Grenga, L. et al. 2017) promettono di cambiare il modo in cui indaghiamo le reti di segnalazione batterica, e farà progredire la nostra comprensione di come i batteri interagiscono con i loro ambienti e mediano le infezioni.

"Le persone hanno esaminato i dati a più di un livello prima, ma non in questa profondità." disse il dottor Malone. "In definitiva, vorremmo che le persone considerassero l'approccio ai dati in questo modo regolarmente, ".