Utilizzando un'analisi eDNA ad ampio raggio combinata con i tradizionali metodi di indagine sulla raccolta, Ricercatori giapponesi hanno identificato il sito di riproduzione di specie ittiche in pericolo di estinzione Acheilognathus typus nella corrente del fiume Omono nella prefettura di Akita, Giappone. I risultati sono stati pubblicati il ​​14 novembre nell'edizione online di La scienza della natura – Naturwissenschaften .

Il rilevamento degli organismi acquatici è un processo lungo e laborioso, e coprire una vasta area comporta anche costi elevati. L'analisi del DNA ambientale (eDNA) fornisce una soluzione a questi problemi. In ambienti subacquei come laghi, bacini idrici e fiumi, possiamo trovare frammenti di DNA alla deriva nell'acqua dalle feci, pelle o qualsiasi altra fonte di organismi che vivono nell'acqua. L'analisi dell'eDNA è particolarmente efficace per specie rare come A. typus, che è difficile da trovare attraverso i metodi di indagine tradizionali a causa della sua bassa densità di popolazione. In questo studio, il team di ricerca ha condotto un'indagine eDNA ad ampio raggio seguita da una tradizionale indagine di raccolta per trovare il nuovo habitat riproduttivo di A. typus nel fiume Omono, Prefettura di Akita, Giappone.

Per tre giorni nell'agosto 2016 il team ha raccolto campioni di acque superficiali da 99 località, coprendo 112 km del fiume Omono, ed estratto eDNA dai campioni. Hanno misurato il DNA utilizzando un sistema di rilevamento specifico per A. typus. Dopodichè, hanno posizionato reti fisse e trappole a bottiglia nei luoghi in cui era stato rilevato l'eDNA e hanno confermato la presenza di pesci adulti. Il team ha anche utilizzato bivalvi (dove A. typus depone le uova) per confermare che si stavano riproducendo.

Nelle 99 località del fiume Omono censite, L'eDNA di A. typus è stato trovato in 2 punti, e in uno di questi luoghi il team ha catturato un esemplare maschio e uno femmina. Le uova sono state trovate nel bivalve nello stesso luogo, quindi sono stati in grado di identificarlo con successo come sito di allevamento di A. typus.

Questi risultati dimostrano che in termini di costi e affidabilità, una combinazione di analisi eDNA e metodi di raccolta tradizionali è molto efficace nell'identificare gli habitat e le aree di riproduzione di specie rare. I metodi si completano a vicenda:il metodo eDNA è adatto al rilevamento di vaste aree, mentre la raccolta del campione è molto affidabile per la conferma delle specie. Questa combinazione di metodi potrebbe aiutare a conservare questa specie trovando più aree di riproduzione e stabilendo aree di conservazione. Potrebbe essere utilizzato anche per altre specie rare e in via di estinzione con una bassa densità di popolazione diffusa su un'ampia area.