Per commemorare il Wellcome Trust Sanger Institute che compie 25 anni nel 2018, l'Istituto ei suoi collaboratori stanno sequenziando 25 nuovi genomi di specie nel Regno Unito. Le ultime cinque specie sono state scelte da migliaia di scolari e membri del pubblico in tutto il mondo, che hanno partecipato al voto online del 25 Genomes Project.
Il progetto potrebbe rivelare perché alcune trote fario migrano verso l'oceano aperto, mentre altri no, o dicci di più sui magnetorecettori negli occhi dei pettirossi che permettono loro di "vedere" i campi magnetici della Terra. Potrebbe anche far luce sul motivo per cui gli scoiattoli rossi sono vulnerabili al virus del vaiolo degli scoiattoli, tuttavia gli scoiattoli grigi possono trasportare e diffondere il virus senza ammalarsi.
Tutti i risultati saranno resi pubblici e porteranno a studi futuri per comprendere la biodiversità del Regno Unito e aiutare la conservazione e la comprensione di queste specie.
L'Istituto Sanger è stato fondato nel 1993 dal Professor Sir John Sulston come parte del Progetto Genoma Umano. L'Istituto ha dato il più grande contributo singolo alla sequenza gold standard del primo genoma umano, che è stato pubblicato nel 2003.
Un genoma è l'insieme completo di istruzioni genetiche di un organismo scritte nel DNA. Ogni genoma contiene tutte le informazioni necessarie per costruire quell'organismo e consentirgli di crescere e svilupparsi.
Dal completamento fondamentale del genoma umano, il Sanger Institute è diventato un leader riconosciuto a livello mondiale nel campo della genomica. Sono già stati sequenziati molti più importanti genomi di riferimento:dai genomi di topo e zebrafish al maiale, gorilla, zanzara e molti altri. Al di là delle specie animali, anche le malattie infettive e i batteri occupano un posto di rilievo nell'elenco dei genomi di riferimento, da salmonella e MRSA a clamidia e malaria. Tutti questi hanno offerto importanti spunti su queste specie in salute e malattia.
Ora, il Sanger Institute ei suoi partner stanno sequenziando in modo completo 25 specie dal Regno Unito. Questo progetto è un piccolo contributo a un'impresa molto più grande, dove scienziati di tutto il mondo si stanno unendo per formare un piano per sequenziare tutta la vita sulla Terra.
Questo progetto è stato reso possibile dalla tecnologia di sequenziamento a lettura lunga PacBio®, che genera genomi di alta qualità. L'Istituto sta collaborando con PacBio e altri leader nel settore della tecnologia, 10x Genomica e Illumina, per creare la visione più completa di questi genomi.
I genomi di alta qualità apriranno le porte agli scienziati per utilizzare queste informazioni, e i ricercatori potrebbero scoprire come le specie del Regno Unito stanno rispondendo alle pressioni ambientali, e quali segreti nascondono nella loro genetica che consente loro di prosperare, o passera.
Le 25 specie sono suddivise in cinque categorie a seconda delle qualità che condividono:Fiorente, specie in aumento nel Regno Unito; annaspando, specie in via di estinzione e in declino; Pericoloso, specie invasive e dannose; iconico, specie tipicamente britanniche che tutti riconosciamo; criptico, specie che sono nascoste o indistinguibili dalle altre in base al solo aspetto.
Le 25 specie che avranno il loro genoma sequenziato sono:
Specie fiorenti:
Specie passeranti:
Specie pericolose:
Specie iconiche:
Specie criptiche:
Cinque specie scelte dal pubblico:
Professor Sir Mike Stratton, Direttore del Wellcome Trust Sanger Institute, ha dichiarato:"Venticinque anni fa il campo della genomica era un'idea in erba e le sue implicazioni erano solo sognate. Oggi la realtà della genomica e dei dati biologici è che sta trasformando la nostra comprensione, diagnosi, e cura delle malattie, che vanno dal cancro e malattie cardiache alla malaria e alle infezioni. La scienza e la tecnologia che stanno guidando questa era di scoperte stanno accelerando la nostra comprensione del corpo umano, ma anche del mondo che ci circonda.
Questo progetto è arrivato dopo molte discussioni ponderate in tutto il mondo su quante specie sul nostro pianeta potrebbero essere sequenziate nei prossimi decenni - in linea di principio, tutti loro. Stiamo dando il nostro contributo per mettere in sequenza tutta la vita sulla Terra".
La dottoressa Julia Wilson, Direttore associato del Wellcome Trust Sanger Institute, ha dichiarato:"Attraverso il sequenziamento di questi 25 genomi, gli scienziati acquisiranno una migliore comprensione delle specie del Regno Unito, come sono arrivati qui, la loro evoluzione, e come le diverse specie si stanno adattando a un ambiente che cambia. I risultati potrebbero rivelare verità nascoste in queste specie, e consentirà alla comunità scientifica di comprendere come il nostro mondo sia in continua evoluzione ed evoluzione intorno a noi. Vogliamo celebrare il 25° anniversario dell'Istituto Sanger in un modo speciale 'Sanger', e sono entusiasta di vedere come si svolge il 25 Genomes Project."
Ken Skeldon, Responsabile dell'impegno pubblico presso il Wellcome Genome Campus, ha dichiarato:"Dare al pubblico l'opportunità di scegliere quali specie hanno i loro genomi sequenziati nel 25 Genomes Project ha portato nuove prospettive al progetto. Siamo lieti di vedere che così tante persone e bambini in età scolare in tutto il Regno Unito e oltre si sono attivamente impegnati in chat online con gli scienziati e votato per le ultime cinque specie."
Tim Littlewood, Il capo delle scienze della vita presso il Museo di storia naturale ha dichiarato:"Il Museo di storia naturale è orgoglioso di collaborare con il Sanger Institute per celebrare il loro 25esimo compleanno e anche per celebrare i progressi che le tecniche molecolari come il sequenziamento del genoma possono portare allo studio del Regno Unito. fauna selvatica. Gli 80 milioni di esemplari di cui ci prendiamo cura, da tutto il mondo, detengono un patrimonio di informazioni genetiche che ci consente di condurre ricerche innovative, affrontare le sfide globali. Un'attenzione particolare alla biodiversità del Regno Unito con tecnologie all'avanguardia è particolarmente apprezzata".
