Con lo sviluppo delle tecnologie di sequenziamento del genoma, nella frutta e nella verdura sono stati identificati molti RNA lunghi non codificanti (lncRNA). Ricerche approfondite sugli lncRNA hanno rivelato il loro ruolo nella regolazione dell'espressione dei geni codificanti le proteine sia a livello trascrizionale che post-trascrizionale, svolgendo così un ruolo cruciale nella crescita, nello sviluppo e nelle risposte allo stress in frutta e verdura.
Una nuova recensione pubblicata su Horticulture Research fornisce un riepilogo completo delle attuali conoscenze sulla formazione, sulle caratteristiche funzionali e sui meccanismi di regolazione degli lncRNA in frutta e verdura.
In base alla direzione della trascrizione e alla posizione rispetto ai geni codificanti le proteine, gli lncRNA sono classificati in quattro tipi:lncRNA intergenici (lincRNA), trascritti antisenso lunghi non codificanti (lncNAT), lncRNA senso e lncRNA intronici (incRNA). In questo articolo, la formazione e le caratteristiche di base degli lncRNA nella frutta e nella verdura sono descritte da tre aspetti:abbondanza e dimensione, struttura e localizzazione, decadimento ed evoluzione.
I ruoli degli lncRNA nella frutta e nella verdura sono stati ampiamente riassunti e discussi in recenti rapporti di ricerca, coprendo vari aspetti tra cui l'accumulo di pigmenti, lo sviluppo degli organi riproduttivi, la maturazione dei frutti, nonché le risposte alla carenza di nutrienti, al sale, alla siccità, alla temperatura e ai batteri patogeni. .
Inoltre, gli autori hanno chiarito i meccanismi regolatori degli lncRNA nella regolazione trascrizionale dei geni e nello splicing alternativo, nonché le interazioni tra gli lncRNA e gli ormoni vegetali, i fattori di trascrizione e i miRNA.
Lo sviluppo della tecnologia di sequenziamento ad alto rendimento ha notevolmente migliorato la capacità di scoprire, prevedere e identificare gli lncRNA. Tuttavia, nei database delle piante relativi agli lncRNA in frutta e verdura permane una scarsità di dati completi sull'analisi dell'lncRNA, il che ostacola la caratterizzazione dell'espressione e della localizzazione dell'lncRNA.
Inoltre, il costo associato agli esperimenti di localizzazione subcellulare degli lncRNA, come FISH, pone una limitazione agli studi sugli lncRNA, evidenziando l'urgente necessità di sviluppare metodi più convenienti per la ricerca sugli lncRNA.
L'esplorazione della funzione e del meccanismo degli lncRNA nelle colture di frutta e verdura è ancora nelle fasi iniziali e il rapido sviluppo della tecnologia porterà nuove opportunità e scoperte per la ricerca sull'lncRNA in frutta e verdura.