Legame a specifiche sequenze di DNA (elementi cis-regolatori):
I fattori di trascrizione contengono domini specifici di legame del DNA che consentono loro di riconoscere e legarsi a brevi sequenze di DNA chiamate elementi cis-regolatori. Questi elementi si trovano nelle regioni promotrici dei geni o in regioni potenziatrici che possono essere localizzate lontano dal gene.
Alterare la struttura della cromatina:
Una volta legati al DNA, i fattori di trascrizione possono indurre cambiamenti nella struttura della cromatina, che è il complesso di DNA e proteine che impacchetta e regola il DNA all’interno del nucleo. I fattori di trascrizione possono reclutare complessi di rimodellamento della cromatina che modificano le proteine istoniche, le unità base della cromatina. Queste modifiche possono allentare la struttura della cromatina, rendendola più accessibile per la trascrizione.
Reclutamento di coattivatori e RNA polimerasi:
I fattori di trascrizione possono reclutare altre proteine, note come coattivatori, nella regione del promotore. I coattivatori interagiscono con i fattori di trascrizione e aiutano nel reclutamento della RNA polimerasi, l'enzima responsabile della trascrizione del DNA in RNA. Portando l'RNA polimerasi nella regione del promotore, i fattori di trascrizione facilitano l'inizio della trascrizione genica.
Interazione con altri fattori di trascrizione e vie di segnalazione:
I fattori di trascrizione spesso lavorano di concerto con altri fattori di trascrizione e vie di segnalazione per regolare l’espressione genica. Possono formare complessi proteici o interagire con molecole di segnalazione per integrare vari segnali cellulari e modulare l'accessibilità del DNA per la trascrizione.
Regolazione della metilazione del DNA e delle modifiche degli istoni:
Alcuni fattori di trascrizione possono anche influenzare i modelli di metilazione del DNA e le modifiche degli istoni, che sono meccanismi aggiuntivi che regolano l’espressione genica alterando la struttura della cromatina. Controllando queste modifiche epigenetiche, i fattori di trascrizione possono ottimizzare ulteriormente l’accessibilità del DNA per l’espressione genica.
Collettivamente, questi meccanismi consentono ai principali regolatori di controllare l’accessibilità del DNA e coordinare i programmi di espressione genetica in risposta a vari segnali cellulari e stimoli ambientali.