Le molecole di RNA sono essenziali per l’espressione genica, poiché agiscono come messaggeri che trasportano le informazioni genetiche dal DNA al meccanismo di produzione delle proteine della cellula. Tuttavia, alcune molecole di RNA hanno vita molto breve, esistendo solo per pochi secondi o minuti, il che le rende difficili da studiare.
La nuova tecnica, chiamata SLAM-seq (per Short-Lived RNA Analysis by Mate-Pair Sequencing), supera questa sfida utilizzando una combinazione di etichettatura chimica e sequenziamento ad alto rendimento per catturare e identificare molecole di RNA di breve durata.
Utilizzando SLAM-seq, i ricercatori sono stati in grado di identificare migliaia di molecole di RNA di breve durata nelle cellule umane e di analizzarne i modelli di espressione. Hanno scoperto che questi RNA di breve durata sono coinvolti in una varietà di processi cellulari, tra cui la crescita cellulare, la differenziazione e l’apoptosi.
I ricercatori hanno anche scoperto che l’espressione degli RNA di breve durata è strettamente coordinata con l’attività della RNA polimerasi II, l’enzima che trascrive il DNA in RNA. Ciò suggerisce che gli RNA di breve durata svolgono un ruolo importante nella regolazione della trascrizione genetica.
La nuova tecnica fornisce un potente strumento per studiare il ruolo degli RNA di breve durata nei processi cellulari e potrebbe portare allo sviluppo di nuove terapie per le malattie causate da interruzioni nel metabolismo dell'RNA.
Lo studio è pubblicato sulla rivista Nature.