Gli scienziati hanno sviluppato una nuova tecnica per mappare le interazioni tra RNA e cromatina nel genoma. Questa tecnica, chiamata ChIRP-nexus (Chromatin Isolation by RNA Purification seguita dall’analisi Nexus), fornisce una visione completa di come le molecole di RNA interagiscono con il DNA e le proteine ​​all’interno del nucleo.

I ricercatori hanno utilizzato ChIRP-nexus per studiare le interazioni tra RNA e cromatina nelle cellule umane. Hanno scoperto che le molecole di RNA interagiscono con un’ampia gamma di regioni della cromatina, inclusi promotori, potenziatori e silenziatori dei geni. Queste interazioni svolgono un ruolo fondamentale nella regolazione genetica, poiché possono controllare l’accessibilità del DNA ai fattori di trascrizione e ad altre proteine.

"Il nostro metodo è una piattaforma estremamente sensibile e versatile per l'analisi globale delle interazioni RNA-cromatina", ha affermato l'autore senior Dr. Chuan He dell'Università di Chicago. "È in grado di identificare le proteine ​​che legano l'RNA in modo imparziale e a livello dell'intero genoma, e i risultati possono essere applicati per comprendere meglio i meccanismi di regolazione genetica e sviluppare nuove strategie terapeutiche per varie malattie."

ChIRP-nexus è un nuovo potente strumento che aiuterà gli scienziati a comprendere meglio come le molecole di RNA interagiscono con la cromatina nel genoma. Queste informazioni saranno essenziali per comprendere la regolazione genetica e sviluppare nuove strategie terapeutiche per un’ampia gamma di malattie.