Gli eucarioti sono qualsiasi tipo di organismo che ha cellule complesse che includono mitocondri, nuclei e altre parti cellulari. I tre principali gruppi cellulari sono funghi, piante e animali. Molti funghi sono legati alle piante solo in modo superficiale. Potrebbero sembrare in qualche modo piante e pareti cellulari simili alle pareti cellulari delle piante, ma esiste un albero di frenologia che mostra come i funghi possano essere più strettamente correlati agli animali rispetto alle piante. Poiché nella storia dell'evoluzione gli animali sono più vicini ai funghi che alle piante, si potrebbe dire che un fungo è più vicino a un essere umano che a una verdura in un'insalata.
Proteine

Le sequenze proteiche dei funghi sono più simili agli animali che alle piante. Ad esempio, la proteina della muffa cellulare della melma assomiglia più alle proteine animali che alle proteine vegetali. La lunghezza dei ribosomi nei funghi mostra un amminoacido simile al muscolo. In effetti, ci sono diverse sequenze di aminoacidi che sono simili alle proteine della catena pesante nei mammiferi. Uno di questi amminoacidi è identico all'81% di un amminoacido umano.
Clorofilla

La cellulosa vegetale è diversa dalla cellulosa fungina. Quando viene sottoposta a raggi X, la cellulosa vegetale è più cristallina della cellulosa fungina. Sia i funghi che gli animali non contengono cloroblasti, il che significa che né i funghi né gli animali possono elaborare la fotosintesi. La clorofilla rende le piante verdi e fornisce nutrimento per le piante. Al contrario, i funghi assorbono i nutrienti dal materiale vegetale in decomposizione attraverso un processo enzimatico e gli animali ingeriscono il loro cibo.
Chitin

I funghi e gli animali contengono entrambi una molecola di polisaccaride chiamata chitina che le piante non condividono. La chitina è un carboidrato complesso usato come componente strutturale. I funghi usano la chitina come elemento strutturale nelle pareti cellulari. Negli animali, la chitina è contenuta nell'esoscheletro degli insetti e nei becchi dei molluschi. La chitina funziona in modo simile alla cellulosa vegetale, ma la chitina è più forte. Gli studi condotti sui polisaccaridi dei funghi hanno dimostrato che l'aggiunta di alcali contenenti azoto ha distrutto i funghi e prodotto acido acetico. Queste reazioni chimiche non si sono verificate nei polisaccaridi vegetali.
I funghi non sono alghe

Le alghe sono le piante più semplici e primitive. Nel 1955, il Dr. George W. Martin concluse che i funghi erano derivati da alghe che avevano perso la clorofilla. Tuttavia, l'ipotesi di Martin non considerava che le condizioni atmosferiche avrebbero potuto essere diverse all'inizio della vita rispetto a come erano nel 1955. Inoltre, Martin non prese in considerazione che i batteri che fissavano l'azoto sarebbero potuti esistere anche prima dell'evoluzione delle piante, che avrebbero potuto essere utilizzate come fonte di cibo per i funghi. Nel 1966, il Dr. A.S. Sussman osservò che mentre i funghi assomigliavano superficialmente alle alghe, c'erano aspetti dei funghi, come i nuclei cellulari e l'organizzazione, che non potevano essere spiegati.
Steroli

Alcuni biologi hanno citato che gli steroli animali e fungini sono diversi , quindi, i funghi non possono essere simili agli animali. Gli animali producono colesterolo, mentre i funghi producono ergosterolo. A un esame più attento, sia gli steroli fungini che quelli animali contengono lanosterolo, mentre i fitosteroli nelle piante verdi contengono cicloartenolo.
La sua stessa categoria?

Forse i funghi non derivano né da piante né da animali a cellula singola. Alcuni biologi hanno sostenuto che i funghi sono filogeneticamente distinti da tutti gli altri eucarioti. I funghi sembrano essere unici nel fatto che da soli richiedono un fattore di allungamento della traduzione chiamato EF-3. Ci sono alcune attività proteiche che sono essenziali per l'allungamento della traduzione in vivo.