- Anaerobi obbligati:questi organismi non possono sopravvivere in presenza di ossigeno e quindi non utilizzano l'ossigeno come accettore finale di elettroni nella respirazione cellulare. Utilizzano invece accettori di elettroni alternativi come solfato, nitrato o fumarato. Esempi di anaerobi obbligati includono alcuni batteri e archaea.
- Anaerobi facoltativi:questi organismi possono passare dalla respirazione aerobica (in presenza di ossigeno) alla respirazione anaerobica (in assenza di ossigeno) a seconda della disponibilità di ossigeno. Quando l'ossigeno è presente, usano la respirazione aerobica, ma quando i livelli di ossigeno diminuiscono, passano alla respirazione anaerobica. Esempi di anaerobi facoltativi includono lieviti, alcuni batteri e alcuni vermi parassiti.
- Anaerobi aerotolleranti:questi organismi normalmente non crescono in presenza di ossigeno ma sono in grado di sopravvivere o crescere in sua presenza. Tuttavia, non utilizzano l'ossigeno come accettore terminale di elettroni nella respirazione; utilizzano percorsi alternativi. Alcuni anaerobi aerotolleranti possono avere enzimi residui per la respirazione, ma questi enzimi non sono attivi in condizioni aerobiche. Gli esempi includono alcuni batteri e funghi.
- Microaerofili:questi organismi richiedono una bassa concentrazione di ossigeno per la crescita e non possono tollerare gli alti livelli di ossigeno presenti nell'atmosfera. Hanno enzimi specializzati e vie metaboliche che funzionano meglio a bassi livelli di ossigeno. Gli esempi includono alcuni batteri e alcune specie di archaea.
- Archaea:mentre alcuni archaea effettuano la respirazione utilizzando catene di trasporto degli elettroni simili a quelle di altri organismi, altri utilizzano meccanismi diversi per generare ATP. Ad esempio, alcuni archaea utilizzano trasportatori di elettroni alternativi, mentre altri utilizzano vie metaboliche uniche come la metanogenesi o l'acetogenesi.
