I funghi sono organismi eterotrofi, nel senso che ottengono i loro composti organici da altri organismi. Sono osmotrofi, nel senso che assorbono i nutrienti dall'ambiente circostante attraverso le pareti cellulari. Il processo attraverso il quale un fungo si nutre può essere così riassunto:

Germinazione delle spore:Le spore fungine germinano quando entrano in contatto con un ambiente adatto. La spora assorbe acqua e sostanze nutritive ed emerge un tubo germinale.

Crescita del micelio:il tubo germinale cresce in una rete di ife, formando un micelio. Il micelio si diffonde attraverso il substrato, assorbendone i nutrienti.

Assorbimento dei nutrienti:le ife fungine secernono enzimi che scompongono la materia organica complessa in composti più semplici che il fungo può assorbire. Questi enzimi possono essere prodotti a livello extracellulare o possono essere localizzati sulla superficie delle ife. Le sostanze nutritive vengono poi assorbite dalle ife per osmosi.

Decomposizione e assorbimento:i funghi svolgono un ruolo vitale nella decomposizione della materia organica. Secernono enzimi che scompongono le piante morte e il materiale animale, rilasciando i nutrienti nell'ambiente. Questi nutrienti vengono poi assorbiti dal micelio fungino.

Nutrizione saprobica:molti funghi sono saprobi, nel senso che ottengono nutrienti dalla materia organica morta o in decomposizione. Questi funghi svolgono un ruolo cruciale nel processo di decomposizione e nel riciclaggio dei nutrienti negli ecosistemi.

Nutrizione parassitaria:alcuni funghi sono parassiti e ottengono nutrienti dagli ospiti viventi. Questi funghi possono causare malattie nelle piante, negli animali e persino in altri funghi.

Nutrizione endofitica:alcuni funghi formano relazioni simbiotiche con le piante, note come endofite. Questi funghi vivono all'interno dei tessuti vegetali senza causare alcun danno e scambiano sostanze nutritive con la pianta.