Il gene FBN1, che codifica per la proteina fibrillina-1, è principalmente associato alla sindrome di Marfan. Tuttavia, non viene utilizzato come strumento diagnostico primario per la sindrome di Marfan. Sebbene le mutazioni nel gene FBN1 siano causative in circa il 90% dei casi della sindrome di Marfan, esiste ancora una percentuale significativa di casi (circa il 10%) in cui non è possibile identificare mutazioni FBN1.

Il processo diagnostico per la sindrome di Marfan prevede una combinazione di valutazioni cliniche, storia familiare e criteri diagnostici specifici stabiliti dai criteri di Ghent. Questi criteri includono valutazioni per varie caratteristiche fisiche, come anomalie scheletriche, problemi agli occhi e manifestazioni cardiovascolari. I criteri di Ghent rivisti, aggiornati nel 2010, forniscono linee guida più complete per la diagnosi della sindrome di Marfan e possono aiutare a identificare le persone affette anche nei casi in cui non viene identificata alcuna mutazione FBN1.

Poiché la sindrome di Marfan può manifestarsi in modo diverso negli individui affetti, per una diagnosi accurata è necessaria una combinazione di valutazioni cliniche, test di imaging e analisi genetica di più geni coinvolti nella condizione (incluso ma non limitato a FBN1). Affidarsi esclusivamente all'analisi del gene FBN1 può far perdere una parte considerevole dei casi, portando a potenziali diagnosi errate o ritardate.